1. 前言

  因课程主要用到两个python程序包，SBDART和最优化反演。我们在此安装miniconda，便于后续安装分别适用于两个程序的环境。其中SDBART需python版本为2.7。基本流程为1、先安装miniconda，2、安装适用于SBDART的环境，3、SBDART运行测试。

2. Miniconda安装

  1、下载Miniconda，链接https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh （群里压缩包里也有）
  2、假如下载文件目录为C:\Users\zoom\Downloads，打开Kali终端，输入

┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$cd /mnt/c/Users/zoom/Downloads/
┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[/mnt/c/Users/zoom/Downloads]
└─$bash Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh

  按照提示一步步进行，其中

Do you wish the installer to initialize Miniconda3 by running conda init ? [yes|no]
[no] >> yes

图片1

3、关闭Kali终端并重新打开（或者在终端$后输入source ~/.bashrc），此时用户名前出现'（base）',表明安装成功。接着配置TUNA提供的 Anaconda 仓库与第三方源（不然安装python相关包会很慢）。
方法一: 通过直接编辑condarc文件进行修改

(base) ┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$conda config --set show_channel_urls yes

执行该命令后，当前目录生成 .condarc

(base) ┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$sudo vim ~/.condarc

把已下内容输入.condarc中

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

方法二、在命令行输入如下：

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
#pytorch
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/peterjc123/
conda config --set show_channel_urls yes

按:wq保存退出编辑

3. SBDART环境安装

根据https://github.com/paulricchiazzi/SBDART可知，SBDART是完全基于Fortran语言编写的，而RunRT是一个基于python (2.7)的图形化code。因此，我们需要配置一个python2.7的环境。

1、由于sbdart需用到Fortran，安装相应软件：

(base) ┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$sudo apt-get install gfortran gcc make automake

2、python2.7安装

(base) ┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$conda create -n sbdart python=2.7.14

执行后，开始安装所需包。完成后，激活环境

(base) ┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$conda activate sbdart

3、安装matplotlib后结束

(sbdart) ┌──(zoom㉿LAPTOP-25F0J0E2)-[~]
└─$conda install matplotlib

4. SBDART使用

1、进入存放SBDART软件包的文件夹

$ cd /mnt/d/CourseATMS/SBDART_fu/

2、编译生成SBDART

$ make -f makefile

图片.png

3、打开kex, 进入RunRT文件夹

$ cd  ./RunRT

$ python RunRT.py

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