在临床过程当中，我发现很多婴幼儿在患了支气管炎之后大量食用抗生素，抑制了正常肠道菌群中的有益微生物的生长，这种时候，致病菌就会在肠道大量增值，出现肠道菌群紊乱的问题，后续可能会出现继发性的腹泻等各种问题。所以很多也有很多医生会给孩子补充一些微生态制剂来缓解症状，补充益生菌，拮抗病原菌，然后恢复正常的肠道菌群结构。
微生态制剂是什么呢，主要是从人体或者是动物和植物的体内分离的有益微生物，经过特殊的公益制成的只含有活菌的活菌剂或者是包含细菌体（活菌或死菌）及其代谢产物的制品。现在微生态制剂作为微生态学防治疾病的非常重要手段，既可以调节肠道微生态平衡，也可以达到恢复人体健康或者增强人体免疫力的目的。当肠道菌群处于一个平衡状态的时候，我们人体的消化、代谢以及免疫系统属于一个平衡的状态，当肠道菌群平衡被体内的各种因素破坏掉，并且超出人体的调节能力的时候，会影响到我们人体正常的生理功能，严重时会导致疾病的发生。
很多时候，也会有可以通过中医药与微生态制剂的联合应用的方式，比如小儿四磨汤，主要是由槟榔、木香、乌药及枳壳组成，是临床治疗小儿功能性消化不良、乳食积滞和胃胀等的常用药，可以通过顺气降逆，消积止痛的效果。
中医理论与肠道菌群的本质关系非常的密切，首先，不管是从中医的角度还是肠道菌群的方面，两者都是诠释天人相应的整体观：中医学主要是以“整体观”为一个理论特点，认为“人与天地相参”、“天人合一”，不但说明人体是一个有机的整体，也说明人和自然也是不可分割的整体；肠道菌群和我们人体也是一个共生的关系，是肠道内环境与生命体之间相互统一的一部分，同时，肠道菌群广泛存在在人体的肠道之中，为我们身体提供一个必要的代谢酶和活性分子，参与免疫应答，维持内环境的稳态等，同时，人体肠道为菌群提供住所和营养，所以人体和肠道菌群也是相辅相成的。
同时，中医认为“正气”是我们人体对环境的一个适应、抵抗和恢复的能力，一切致病因素都是都是“邪气”，“正气存内, 邪不可干”说的是人体正气旺盛, 邪气不易侵入。“邪之所凑, 其气必虚”是阐述人体抵抗与防御能力变弱时, 邪气容易侵入, 从而导致疾病的产生，在肠道菌群中既存在乳酸菌、双歧杆菌等有益菌，也有沙门菌 、大肠杆菌等有害菌，正常情况下，我们人体的肠道菌群数量、结构保持相对平衡，“正邪”相互制约和拮抗，维持着人体的正常的状态，但是当身体有害菌大量定植的时候，“正不压邪”，人体就会产生疾病。因为如果身体受到饮食和气候的影响，这样话也会会使得致病菌大量的增殖，使人体的肠道微生态失衡，从而产生肠道疾病，同时小儿肠粘膜通透性高，微生物可以自由通过，所以也会导致胃肠道功能受到肠内内外条件影响而发生紊乱。
“药食同源”的历史非常的悠久，是中医学中增强人体正气的很独有的方式，我们可以通过一些有治疗作用的食物来增强人体正气，甚至是达到治病的可能。举个例子来说，真菌猴头菇又称为“蘑菇之王，养胃山珍”，在中医看来具有很好的养胃和中的作用，脾胃为后天之本，所以养胃和中也是提高我们人体正气的一个有效途径，同时在我们的药膳课程中也有针对相应体质选择的猴头菇制作的药膳。
