学习小组-Day1-GAGA

在学习中遇到问题怎么办??

  • 自己搜索
    通过搜索引擎搜索下载软件、解决报错、某个不够详细的点想要自学。
    搜索引擎:谷歌(首选)——必应(其次)——虫部落快搜(里面涵盖所有的搜索引擎)
    专业教程:搜狗微信——搜狗知乎——简书——github
  • 和小组成员讨论
  • 如何提问??礼貌提问,描述问题需要用截图

搭建高效学习平台

  • 浏览器:谷歌浏览器可以添加插件,即时翻译的“沙拉查词”,实现pubmed直接显示影响因子的Scholarscope等
  • 电脑文件搜索:Everything(windows)
  • 快捷截图软件 snipaste:双击打开,F1是快捷键!!!
  • 电脑版微信:使用截图和文件传输助手

电子笔记

  • 两个思维导图软件:幕布xmind(推荐用markdown格式)

markdown编辑器操作

  • 新建一篇空白笔记——预览模式(左边为编辑区域,右边为预览区域,在左边输入markdown语法的文本,右边就会呈现出来)

?设置标题:#和标题之间建议保留一个字符的空格,一级标题一个#,二级标题两个#

?设置列表:在文字前面加上-

  • 文本1
  • 文本2
  • 文本3

?有序列表

  1. 文本
  2. 文本
  3. 文本

?插入链接显示文本!!!
Seurat

?引用:在引用的文字前面加上>

一盏灯...

?粗体和斜体:用两个包含的一段文字就是粗体,用一个包含的一段文本就是斜体
一盏灯,一片黄昏;一简书,一杯淡茶...

?代码引用:如果引用的语句只有一段,不分行,可以用·将语句包起来;如果引用的语句为多行,可以将···加在这段代码的首行和末行。

seurat标准分析(去掉可视化的步骤)
pbmc.counts <- Read10X(data.dir = "pbmc3k/filtered_gene_bc_matrices/hg19/")
pbmc <- CreateSeuratObject(counts = pbmc.counts)
pbmc <- NormalizeData(object = pbmc)
pbmc <- FindVariableFeatures(object = pbmc)
pbmc <- ScaleData(object = pbmc)
pbmc <- RunPCA(object = pbmc)
pbmc <- FindNeighbors(object = pbmc)
pbmc <- FindClusters(object = pbmc)
pbmc <- RunTSNE(object = pbmc)
pbmc <- RunUMAP(object = pbmc)
DimPlot(object = pbmc, reduction = "tsne")
Dimplot.png
最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 217,185评论 6 503
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,652评论 3 393
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 163,524评论 0 353
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,339评论 1 293
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,387评论 6 391
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,287评论 1 301
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,130评论 3 418
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,985评论 0 275
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,420评论 1 313
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,617评论 3 334
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,779评论 1 348
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,477评论 5 345
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,088评论 3 328
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,716评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,857评论 1 269
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,876评论 2 370
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,700评论 2 354

推荐阅读更多精彩内容