在学习中遇到问题怎么办??
- 自己搜索
通过搜索引擎搜索下载软件、解决报错、某个不够详细的点想要自学。
搜索引擎:谷歌(首选)——必应(其次)——虫部落快搜(里面涵盖所有的搜索引擎)
专业教程:搜狗微信——搜狗知乎——简书——github - 和小组成员讨论
- 如何提问??礼貌提问,描述问题需要用截图
搭建高效学习平台
- 浏览器:谷歌浏览器可以添加插件,即时翻译的“沙拉查词”,实现pubmed直接显示影响因子的Scholarscope等
- 电脑文件搜索:Everything(windows)
- 快捷截图软件 snipaste:双击打开,F1是快捷键!!!
- 电脑版微信:使用截图和文件传输助手
电子笔记
- 两个思维导图软件:幕布和xmind(推荐用markdown格式)
markdown编辑器操作
- 新建一篇空白笔记——预览模式(左边为编辑区域,右边为预览区域,在左边输入markdown语法的文本,右边就会呈现出来)
?设置标题:#和标题之间建议保留一个字符的空格,一级标题一个#,二级标题两个#
?设置列表:在文字前面加上-
- 文本1
- 文本2
- 文本3
?有序列表
- 文本
- 文本
- 文本
?引用:在引用的文字前面加上>
一盏灯...
?粗体和斜体:用两个包含的一段文字就是粗体,用一个包含的一段文本就是斜体
一盏灯,一片黄昏;一简书,一杯淡茶...
?代码引用:如果引用的语句只有一段,不分行,可以用·将语句包起来;如果引用的语句为多行,可以将···加在这段代码的首行和末行。
seurat标准分析(去掉可视化的步骤)
pbmc.counts <- Read10X(data.dir = "pbmc3k/filtered_gene_bc_matrices/hg19/")
pbmc <- CreateSeuratObject(counts = pbmc.counts)
pbmc <- NormalizeData(object = pbmc)
pbmc <- FindVariableFeatures(object = pbmc)
pbmc <- ScaleData(object = pbmc)
pbmc <- RunPCA(object = pbmc)
pbmc <- FindNeighbors(object = pbmc)
pbmc <- FindClusters(object = pbmc)
pbmc <- RunTSNE(object = pbmc)
pbmc <- RunUMAP(object = pbmc)
DimPlot(object = pbmc, reduction = "tsne")
Dimplot.png