民谚道：天有三宝：日、月、星，地有三宝：水、火、风。而人也有三宝则是：精、气、神，三宝之中，以“神”为统领，是生命的灵魂。相应的人体三大要穴有：百会穴，可益“神”；神阙穴，可补气；涌泉穴，可生“精”。
百会穴首见于《针灸甲乙经》，位于头顶正中线与两耳尖连线的交叉处，归属于督脉，人体的手足三阳经（手太阳小肠经、手阳明大肠经、手少阳三焦经；足太阳膀胱经、足阳明胃经、足少阳胆经）在这里与督脉会合，为人体阳气盛极之处，故中医称其为“诸阳之会”。
百会穴居巅顶，也曾称昆仑穴，因为从中国的地势来讲，昆仑山脉是群山之首，尤如世界屋脊，所有的山脉河流多是由此源源而下，有“中国第一神山”、“万祖之山”之称。取昆仑之名，意喻此穴位和昆仑山脉一样，俯瞰着大地万物。后因为与脚后跟的昆仑穴同名，故取消了这一名字。
《古法新解会元针灸学》记载：“百会者，五脏六腑奇经三阳百脉之所会，故名百会”。道家称百会穴为“一身之宗，百神之会”，就好像电视剧里面的华山论剑，各路英雄豪杰汇聚于此，兼四周经穴密布，大有百脉朝宗，君临天下之势。中医认为脑为元神之府，若将其比作京城，则天子脚下，能人异士很多，所以也从来都是是非纷扰之地，百会穴寄居此地，要负起保障一方安宁的作用。所以，百会穴可主百病。
归纳总结百会穴的主治疾病有：
1．百会穴具有开窍醒脑、回阳固脱的功效。故但凡脑部的疾病，如头痛（配曲鬓穴、天柱穴治脑血管痉挛、偏头痛）、头晕目眩（配养老穴、风池穴、足临泣穴治美尼尔氏综合征）、失眠、焦躁、癫痫（配水沟穴、京骨穴治疗大发作）、卒中（失音不能言语配天窗穴；配人中穴、合谷穴、间使穴、气海穴、关元穴治尸厥、气脱），都可以通过百会穴治疗。
2. 百会穴对于人体最重要的血液循环也可以调理，如高血压或低血压（配水沟穴、足三里穴），可以通过刺激穴位来调理血压。现代研究表明，百会穴浅表分布着丰富的神经和血管，如枕大神经、额神经分支，深层为大脑皮层运动区和旁中央小叶附加运动区，局部为周边向中央结聚的动静脉网，因此刺激此穴对改善中枢神经的功能及血液循环有直接调节作用。有研究发现，将一块砭石放在百会穴，通过微循环监视器上可以看到，血流量能够增加20%以上。
3. 可治疗气陷、气脱证，如小儿脱肛（配长强穴、大肠俞穴）。
4. 可治疗炎症（配肾俞穴，回旋灸）
5. 可戒烟（配神门穴）
……
在中医临床上，对百会穴的治疗可采用针刺、艾灸、放血、埋线、药敷等方法。另外老百姓长期坚持对百会穴进行保健或锻炼，可达到益智开慧，补阳填阴，澄心清神，延年益寿的作用，但保健手法应轻柔，如每次按顺时针方向和逆时针方向各按摩50遍，每天3次，效果良好。另外，还可以采用空心掌叩击，点揉、温灸、刮痧、梳头等方法进行日常保健。
