文章
标题：Phylogenetic Analysis Reveals Distinct Evolutionary Trajectories of the Fluoroquinolones- Resistant Escherichia coli ST1193 From Fuzhou
中文：系统发育分析揭示了福州耐氟喹诺酮类大肠杆菌ST1193的不同进化轨迹
期刊：Front Microbiol
时间：2021
要点
- 大肠杆菌(e.c oli) ST1193是一种新兴的氟喹诺酮类耐药和毒性菌株
- 76个E. coli ST1193基因组在全球范围内系统发育分析
- o型O75的分离株占94.7% K5荚膜占9.33%，K1荚膜占90.67%
- 核心基因组分析结果显示分为2个进化支：进化支A包括25株非中国产大肠杆菌ST1193，进化支B包括福州地区分离的所有分离株
- 150个进化枝特异基因中发现了indel，这些基因富集在生物过程和分子功能中
- 非中国A支和中国B支耐药基因(ARGs)、毒力因子和质粒复制子类型差异有统计学意义(p < 0.05)
- 遗传环境分析表明，blaCTX-M-55侧翼环境具有多样性
E. coli ST1193核心基因进化树
150 clade-specific genes的GO富集分析
毒力因子，质粒复制型，抗生素耐药基因在76 E. coli ST1193基因组中
国内外毒力因子，质粒复制型，抗生素耐药基因的比较
blaCTX−M−55 的遗传环境
