The tidyverse style guide_Part I

最近群里契卡大佬分享了一本薄薄的小册子:《The tidyverse style guide 》,是Hadley Wickham 自己写的关于Tidyverse的编程范式。看了第一部分觉得甚好,在这里随便写下翻译,作为自己的cheatsheet。(第二部分是关于R包里面的范式,暂时还用不到)

书来源:
The tidyverse style guide

前言:

  • 有两个R包支持Tidyverse的编程范式引导:stylerlintr

Charpter 1:Files

  • 文件的命名要避免特殊符号,坚持用数字、字母、-_

    # Good
    fit_models.R
    utility_functions.R
    
    # Bad
    fit models.R
    foo.r
    stuff.r
    
  • 如果文件是有顺序的,在文件名之前带上数字前缀。如果你有超过10个文件,左边留一个0.

    00_download.R
    01_explore.R
    ...
    09_model.R
    10_visualize.R
    
  • 如果中间遗留了什么步骤,可以尝试用 02a 或者 02b 这种。但还是建议重新命名

  • 注意不同操作系统之间的大小写敏感问题。最好文件名都是小写的,永远不要有两个文件的名字只是大小写不一样。

  • -= 的注释行来把你的文件分成一个个块

    # Load data ---------------------------
    
    # Plot data ---------------------------
    
  • 如果你的脚本需要附加包,在一开始就载入他们。这会比你在整个文件中到处加载代码或者在启动文件(比如说.Rprofile)中隐藏地加载要好。

Charpter 2:Syntax

  • 变量和函数的名字应该只用小写字母,数字和 _

    # Good
    day_one
    day_1
    
    # Bad
    DayOne
    dayone
    
  • 基本的R会用在函数名(contrib.url())或者类名(data.frame) 中用到 .,但最好只为S3系统保留点这个符号。

  • 变量名最好是名词而函数名最好是动词。

    # Good
    day_one
    
    # Bad
    first_day_of_the_month
    djm1
    
  • 避免重复使用常见的函数和变量

    # Bad
    T <- FALSE
    c <- 10
    mean <- function(x) sum(x)
    
  • 像平常的英语语法一样,经常在逗号后面放一个空格,而不是在逗号前面

    # Good
    x[, 1]
    
    # Bad
    x[,1]
    x[ ,1]
    x[ , 1]
    
  • 对于常规函数的调用,不要在圆括号的里面或者外面放空格

    # Good
    mean(x, na.rm = TRUE)
    
    # Bad
    mean (x, na.rm = TRUE)
    mean( x, na.rm = TRUE )
    
  • 当使用if, for, 或者 while 的时候,在 () 的前面和后面放空格

    # Good
    if (debug) {
      show(x)
    }
    
    # Bad
    if(debug){
      show(x)
    }
    
  • Place a space after () used for function arguments:

    # Good
    function(x) {}
    
    # Bad
    function (x) {}
    function(x){}
    
  • 大部分中缀操作符 (==, +, -, <-, etc.) 的前后都应该有空格

    # Good
    height <- (feet * 12) + inches
    mean(x, na.rm = 10)
    
    # Bad
    height<-feet*12+inches
    mean(x, na.rm=10)
    
  • 但也有些例外

    • 有高优先权的一些操作符:::, :::, $, @, [, [[, ^, unary -, unary +, and :

      # Good
      sqrt(x^2 + y^2)
      df$z
      x <- 1:10
      
      # Bad
      sqrt(x ^ 2 + y ^ 2)
      df $ z
      x <- 1 : 10
      

      unary指的是一元运算符,unary - 指的应该是 -2,-3这种负号。

    • 当右侧的表达式是单个identifier,单边的公式

      # Good
      ~foo
      tribble(
        ~col1, ~col2,
        "a",   "b"
      )
      
      # Bad
      ~ foo
      tribble(
        ~ col1, ~ col2,
        "a", "b"
      )
      
    • 当右边的表达式很复杂的时候,单边公式应当有个空格

      # Good
      ~ .x + .y
      
      # Bad
      ~.x + .y
      
    • 有tidy计算符的时候,比如 !!!!!

      # Good
      call(!!xyz)
      
      # Bad
      call(!! xyz)
      call( !! xyz)
      call(! !xyz)
      
    • 帮助符

      # Good
      package?stats
      ?mean
      
      # Bad
      package ? stats
      ? mean
      
  • 为了对齐 =<- ,可以加一些额外的空格

    # Good
    list(
      total = a + b + c,
      mean  = (a + b + c) / n
    )
    
    # Also fine
    list(
      total = a + b + c,
      mean = (a + b + c) / n
    )
    
  • 一个函数的参数往往分成两大类, 一种是用来放要计算的数据的,另一种是控制计算的细节的。当调用一个函数的使用,你可以选择性地忽略掉数据参数的名字,因为他们很常用。

    # Good
    mean(1:10, na.rm = TRUE)
    
    # Bad
    mean(x = 1:10, , FALSE)
    mean(, TRUE, x = c(1:10, NA))
    

    避免参数的部分匹配

  • 对于花括号的使用有一些准则

    • { 应该是行的最后一个字符。一些相关的代码(e.g., an if clause, a function declaration, a trailing comma, …) 必须和 { 在同一行
    • 缩进应该是两个空格
    • } 应该是行的第一个字符
    # Good
    if (y < 0 && debug) {
      message("y is negative")
    }
    
    if (y == 0) {
      if (x > 0) {
        log(x)
      } else {
        message("x is negative or zero")
      }
    } else {
      y^x
    }
    
    test_that("call1 returns an ordered factor", {
      expect_s3_class(call1(x, y), c("factor", "ordered"))
    })
    
    tryCatch(
      {
        x <- scan()
        cat("Total: ", sum(x), "\n", sep = "")
      },
      interrupt = function(e) {
        message("Aborted by user")
      }
    )
    
    # Bad
    if (y < 0 && debug) {
    message("Y is negative")
    }
    
    if (y == 0)
    {
        if (x > 0) {
          log(x)
        } else {
      message("x is negative or zero")
        }
    } else { y ^ x }
    
  • 如果函数在一行的话,也可以不加花括号。只要其没有副作用(但像print,stop这种似乎是由副作用的)

    # Good
    y <- 10
    x <- if (y < 20) "Too low" else "Too high"
    
  • 会影响控制流(like return(), stop() or continue)的函数调用应该在其自己的 {} 块内

    # Good
    if (y < 0) {
      stop("Y is negative")
    }
    
    find_abs <- function(x) {
      if (x > 0) {
        return(x)
      }
      x * -1
    }
    
    # Bad
    if (y < 0) stop("Y is negative")
    
    if (y < 0)
      stop("Y is negative")
    
    find_abs <- function(x) {
      if (x > 0) return(x)
      x * -1
    }
    
  • 每行的代码应该控制在80个字符左右,这样才方便后来的打印。要学会断行。

    # Good
    do_something_very_complicated(
      something = "that",
      requires = many,
      arguments = "some of which may be long"
    )
    
    # Bad
    do_something_very_complicated("that", requires, many, arguments,
                                  "some of which may be long"
                                  )
    
  • 对于一些很常见的参数,你可以不写参数名字。如果不写参数名的参数很短,可以放在一行里面。

    map(x, f,
      extra_argument_a = 10,
      extra_argument_b = c(1, 43, 390, 210209)
    )
    
  • 如果几个参数很相关,那么就可以放在一行里面,比如说 paste 或者 stop 这种。

    # Good
    paste0(
      "Requirement: ", requires, "\n",
      "Result: ", result, "\n"
    )
    
    # Bad
    paste0(
      "Requirement: ", requires,
      "\n", "Result: ",
      result, "\n")
    
  • 在变量赋值的时候使用 <- 而不是 =

    # Good
    x <- 5
    
    # Bad
    x = 5
    
  • 不要用 ; ……(个人觉得)

  • 在用引号包字符串的时候,用 "" 而不是 '' 。唯一的例外是你字符串里面有双括号,而没有单括号。

    # Good
    "Text"
    'Text with "quotes"'
    '<a href="http://style.tidyverse.org">A link</a>'
    
    # Bad
    'Text'
    'Text with "double" and \'single\' quotes'
    
  • 在写代码的时候,注释是用来标记重要的发现和决定的。如果你需要注释来解释你的代码在干什么,那么就要考虑重写你的代码,从而让你的代码更加清楚。如果你发现你的注释比代码多了,考虑用Rmarkdown。

Charpter 3:Functions

  • 和之前说的一样,函数名应该用动词

    # Good
    add_row()
    permute()
    
    # Bad
    row_adder()
    permutation()
    
  • 函数里面的参数要对齐

    # Good
    long_function_name <- function(a = "a long argument",
                                   b = "another argument",
                                   c = "another long argument") {
      # As usual code is indented by two spaces.
    }
    
    # Bad
    long_function_name <- function(a = "a long argument",
      b = "another argument",
      c = "another long argument") {
      # Here it's hard to spot where the definition ends and the
      # code begins
    }
    
  • return只用在早期的返回值上,后面的返回值依赖于R的自动返回。

    # Good
    find_abs <- function(x) {
      if (x > 0) {
        return(x)
      }
      x * -1
    }
    add_two <- function(x, y) {
      x + y
    }
    
    # Bad
    add_two <- function(x, y) {
      return(x + y)
    }
    
  • return应该在其自己那行

    # Good
    find_abs <- function(x) {
      if (x > 0) {
        return(x)
      }
      x * -1
    }
    
    # Bad
    find_abs <- function(x) {
      if (x > 0) return(x)
      x * -1
    }
    
  • 如果你的函数主要是为了其副作用(打印,画图或者保存到硬盘里面),其应该让第一个参数隐式。这可以让这个函数作为管道的一部分。print 函数应该经常是这样的。一个来自 httr 的例子

    print.url <- function(x, ...) {
      cat("Url: ", build_url(x), "\n", sep = "")
      invisible(x)
    }
    
  • 在代码中,注释应该是解释为什么,而非你要做什么或者怎么做。每个注释都应该以注释符号# 开头,再加上一个空格

    # Good
    
    # Objects like data frames are treated as leaves
    x <- map_if(x, is_bare_list, recurse)
    
    
    # Bad
    
    # Recurse only with bare lists
    x <- map_if(x, is_bare_list, recurse)
    
  • Comments should be in sentence case, and only end with a full stop if they contain at least two sentences:

    # Good
    
    # Objects like data frames are treated as leaves
    x <- map_if(x, is_bare_list, recurse)
    
    # Do not use `is.list()`. Objects like data frames must be treated
    # as leaves.
    x <- map_if(x, is_bare_list, recurse)
    
    
    # Bad
    
    # objects like data frames are treated as leaves
    x <- map_if(x, is_bare_list, recurse)
    
    # Objects like data frames are treated as leaves.
    x <- map_if(x, is_bare_list, recurse)
    
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