Human Protein Atlas（简称HPA）数据库（https://www.proteinatlas.org/），2003年由瑞典 Knut & Alice Wallenberg基金会创建，它致力于提供全部24000多种人类蛋白质的组织和细胞分布信息，检查每一种蛋白质在多种人类正常组织、肿瘤组织、细胞系和血液细胞内的分布和表达情况，其结果用免疫组化染色图表示，并有专业人员标引。资源中的所有数据都开放访问。
那HPA数据库都有什么内容呢？接下来请跟着小编的节奏我们来了解一下HPA数据库。首先，我们在搜索栏输入目的基因或蛋白（以TP53为例）。
搜索跳转新的页面，包括对该基因或蛋白的描述，以及证据可靠性等级和各种图谱结果（Tissue、Brain、Single cell、Pathology、Disease、Immune、Blood、Subcell、Cell line、Structure、Interaction）。每个图谱都有圆形标识，完整圆形表明证据级别最高（enhanced），其次是3/4（supported），1/2(approved)，1/4(uncertain)，N/A表示目前无相关数据或相关数据较少。
选择目标基因/蛋白后，能看到基因/蛋白的“Summary”栏信息，包括基因/蛋白的基础信息，蛋白表达和定位信息、组织RNA表达信息、免疫细胞的特异性和表达簇、癌症的预后及特异性、细胞系相关信息、血液中的蛋白质信息及蛋白质功能信息。
在左侧的“ANTIBODY DATA”中可以查阅抗体和干扰RNA的表达情况。The Human Pathology Atlas数据库中的蛋白质，都有对应抗体的上百张不同实验类型验证结果图，包含IHC、WB、IF等。
一些比较常用的专栏
“TISSUE”栏，主要包括一般信息（基因名称，描述，蛋白分类，预测位置，转录本数目），蛋白图谱信息（RNA表达组织特异性，RNA表达组织分布，蛋白证据等级，蛋白表达定位），免疫组化数据可靠性（数据可靠性，评分，相应抗体）。
下拉页面我们能发现RNA和蛋白表达图谱，按照人体器官分布，左侧显示的是RNA表达，右侧是蛋白的表达。我们能发现该基因/蛋白在不同的性别的不同器官表达量有差异。
点击也可以查看到基因/蛋白在不同系统中的器官中的表达情况。
HPA整理并提供了三个转录组学数据，分别是HPA，GTEx，和Consensus。
HPA也整理并提供查阅不同抗体在不同器官中的适用性数据资料，方便我们在实验设计前选择合适的抗体。
“PATHOLOGY”栏，存在General information， Human protein atlas information， 可以选择不同的肿瘤，每个肿瘤类型提供数十个病人的年龄、性别、人种、癌症阶段、预后时间，以及生存散点图、生存分析、对应的肿瘤组织IHC染色结果图等信息。
同时该专栏还会有不同的组织器官/肿瘤组织的IHC的染色结果图，如果在工作中没有做临床样本实验，很多文章也会引用摘录这里的结果作为佐证。
“SUBCELL”栏，存在General information，Human protein atlas information，Single cell types以及Single cell tissue。在这个专栏里我们能看到该蛋白在细胞中的表达位置。
我们可以查阅基因/蛋白在不同系统中细胞系中表达情况（后面也有Cell line专栏）。
Subcell能够告诉我们基因表达的空间位置以及表达强度。
siRNA相关能告诉我们RNA干扰后的表达水平，能作为生信分析时湿实验验证的数据补充。
“CELL LINE”栏，能看到该基因/蛋白在不同的组织中不同细胞系的RNA表达量。但不如CCLE详细，如何更优的选择实验所用的细胞系，后续小编也会介绍给大家。
“STRUCTURE”栏，主要展示了TP53的基本信息，此处还提供了一些有用的外链数据库，比如Uniprot数据库，便于快速查询TP53的其它关键信息，如氨基酸序列、长度、蛋白功能和二、三级结构等。
“INTERACTION”栏，收录了与目标蛋白相互作用的各种蛋白，十分齐全。同时进行了直接作用和间接作用分类，作用级别排序，甚至对互作的所有蛋白按照定位、组织特异性和蛋白类型进行分类标注。
HPA数据库网站列出了蛋白抗体的详细信息，包括供应商（Sigma-Aldrich）、来源物种（兔/鼠）、单/多抗、纯化方法等。提供了每种抗体已有的具体实验结果，包括免疫荧光、免疫组化和WB等，这些信息可为大家选择抗体提供指导。提供了细胞尺度下的蛋白表达情况，其中比较关键的信息是蛋白在不同细胞类群、以及同一细胞内的空间分布情况，这些数据以免疫检测实验结果展示，为后续实验参考提供了极大的便利。
HPA数据库的内容太丰富了，今天分享的只是数据库的一小部分内容，其它部分还请大家自行探索哟，后续我们还会分享更多的关于HPA数据库的功能，包括如何使用HPA数据库进行文章实验补充。
