1.数据准备（以CYP450为例）
a.CYP450隐马尔可夫模型（hmm模型）准备
Pfam数据库：http://pfam-legacy.xfam.org/
InterPro数据库：https://www.ebi.ac.uk/interpro/
在Pfam数据库下载：（后期可能不可用）
1.png
2.png
3.png
下载到P450家族基因的结构域模型。
或者直接查阅文献，得到P450家族基因在Pfam数据中的号为PF00067，直接搜索下载
在InterPro数据库：（一个新的蛋白质数据库，整合了Pfam、NCBIfam、PIRSF、SMART等多个数据库）
4.png
5.png
6.png
同样可以下载到P450家族基因的结构域模型。
b.拟南芥P450家族基因蛋白序列
TAIR（拟南芥数据库）：https://www.arabidopsis.org/index.jsp
7.png
8.png
9.png
获得拟南芥P450蛋白序列的id
10.png
通过id和网站的序列提取，获得序列信息
复制粘贴或者直接Ctrl+S保存，即可都得到拟南芥的P450蛋白序列，若希望得到更加精确的数据，可以再加上水稻或其他模式植物的家族蛋白序列。
数据准备就差不多啦，下一篇我们开始鉴定~
等等，你还需要一整套的基因组文件（不过我相信大家都是有的）
包括基因组文件：genomic.fasta
蛋白质文件：genomic.pep.fa
CDS序列：genomic.cds.fa
基因结构文件：genomic.gff3
