生信小组Day6 R包使用

一 安装并使用R包

  1. 使用install.package函数或者BiocManager::install函数
    biocmanager类似于conda,是适用于生物学类大部分的R包网站,可以避免大部分的报错问题。
  2. 使用library和require函数使用R包

二 学习dplyr包

  1. 新增列
    mutate函数,增加时设定列名称
  2. 筛选列
    select函数,指定想要的列,可以按照列名也可以指定列数,但一般可以直接使用[ , ]的方式使用。
  3. 筛选行

    filter函数,筛选某一列的值是否符合并将行内容返回。
  4. 对列进行排序
    使用arrange函数进行排序,默认为从小到大,可使用dec函数从大到小排序,在排序为字符列时,默认为a-z,否则为z-a。
  5. 汇总

    使用summarise函数,同时联合group_by函数。使用summarise的好处在于可以使用管道符%>%传递
  6. 计数

    使用count函数对结果进行计数统计,可以对字符统计,也可对数字统计,此时数字被视为字符。
  7. 连接两个数据框
    inner_join取两者交集
    left_join取左部分
    full_jion全部连接,包括空白部分。
    anti_join取两者的补集。
    8.合并数据框
    使用bind_rows合并列,bind_cols合并行。
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