首先你的电脑要配置好java环境变量，如果不懂得可以上网搜，使用java -version检测java环境变量是否配置成功。

1、选择Tools-Build System-new build System ....

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在文件中保存如下内容：

{
    "cmd": ["javac", "$file_name","&&","java", "$file_base_name"],
    "file_regex": "^(...*?):([0-9]*):?([0-9]*)",
    "selector": "source.java",
    "shell": true,
    "encoding": "GBK"
}

保存的文件名称为：
Java.sublime-build
文件保存在....\Sublime Text 3\Packages\User文件夹之下

使用快捷键：ctrl+shift+b就可以出现如下对话框，选择Java就可以编译运行了

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如果出错还会有如图所示非常人性化的提示。
当然第2、3...n次在编译运行时就可以直接使用快捷键ctrl+b了

当然也可以直接设置为默认，如下图所示，选中Java即可

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配置外部运行程序

{
"cmd": ["javac","-encoding","UTF-8","-d",".","$file"],
"file_regex": "^(...*?):([0-9]*):?([0-9]*)",
"selector": "source.java",
"encoding":"GBK",
//执行完上面的命令就结束

// 下面的命令需要按Ctrl+Shift+b来运行
"variants":
    [
        {
            "name": "Run",
            "shell": true,
            "cmd" :  ["start","cmd","/c", "java ${file_base_name} &echo. & pause"],
            // /c是执行完命令后关闭cmd窗口,
            // /k是执行完命令后不关闭cmd窗口。
            // echo. 相当于输入一个回车
            // pause命令使cmd窗口按任意键后才关闭
            "working_dir": "${file_path}",
            "encoding":"GBK"
        }
    ]
}

此时可以看到javaC - OUTSET - Run这个选项，点击可以
在dos窗口显示结果。

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附： 配置Javap反编译class文件源代码

同样的选择Tools-Build System-new build System ....

{
    "cmd": ["javac", "$file_name","&&","javap","-c", "$file_base_name"],
    "file_regex": "^(...*?):([0-9]*):?([0-9]*)",
    "selector": "source.java",
    "shell": true,
    "encoding": "UTF-8"
}

保存为Javap.sublime-build， 如图所示按ctrl+shift+b选中javap即可，第二次或者以后直接使用ctrl+b即可