2019-11-23

1.登录到openssh,在确认软件都有后输入代码
conda install -c bioconda multiqc
输入后结果如下

1.png

2.确认安装成功
multiqc -h
3.从NCBI上面查找一些序列,在这里我找的是SRR8568047和SRR7511216,下载并解压这两个序列2.png
3.png

4.对上图四个gz文件进行fastqc评估
fastqc SRR8568047_1.fastq.gz
其余三个一样。
5.进行multiqc评价
multiqc .
4.png

ls
找到multiqc_report.html文件

5.png

然后再openssh旁边的文件夹目录,将次文件下载到本地,并用浏览器打开
6.png

在这里面就可以得到我们想要的对数据质量的评价。

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