多细胞
1、多细胞是怎样产生的？
2、为什么要去除多细胞或若是不去除多细胞对后续分析有何影响？
3、去除双/多细胞是在分析的哪一步进行，质控前还是质控后？
4、列举去除双/多细胞的软件和简单描述算法过程？
5、怎样评估去除多细胞的结果，一是纵向比较，比如不去除多细胞后续分析得到结果，去除多细胞后续分析得到结果，然后后者咋就比前者好了；二是横向比较，相当于软件测评，这个软件得到的结果咋就比那个软件好/坏；上述主要的评价指标是什么？
PCA
流程思维：
1、如何自动选择最优PCs用于下游分析？
2、有哪些方法思路或软件可以用？
3、结果评估？
https://hbctraining.github.io/scRNA-seq/lessons/elbow_plot_metric.html
任务：DoubletFinder流程封装成一个R包，顺便学习R包怎么写。
单细胞聚类最优cluster或分辨率选择，自动化
1、silhouette width
2、clustertree
3、auc
4、graph modularity
相当于聚类算法中确定聚类中心的个数及评估
Calinski Harabasz index
肘方法（误差平方和 SSE）
蒙特卡洛方法
戴维森堡丁指数(DBI) davies_bouldin_score
Compactness(紧密性)(CP)
Separation(间隔性)(SP)
Dunn Validity Index (邓恩指数)(DVI)
