7. covBars
# Example input to x
x <- matrix(sample(1e+05, 500), nrow = 50, ncol = 10, dimnames = list(0:49, paste0("Sample", 1:10)))
covBars(x)
8. cnFreq
准备数据:
image.png
代码:
cnFreq(LucCNseq)
图:
image.png
9. ideoView
准备数据:
image.png
代码:
# Obtain cytogenetic information for the genome of interest
data <- cytoGeno[cytoGeno$genome == "hg38", ]
# Call ideoView for chromosome 1
ideoView(data, chromosome = "chr1", txtSize = 4)
10. lohSpec(Loss of Heterozygosity Spectrum)
准备数据:
image.png
代码:
lohSpec(x = HCC1395_Germline)
image.png
之前练习的图在这里:
GenVisR 基因组数据可视化实战 (一)
GenVisR 基因组数据可视化实战(二)
GenVisR 基因组数据可视化实战(三)
GenVisR 基因组数据可视化实战(四)