结直肠多组学文章解析 -20200909

​    最近想必大家在公众号上看到一则消息,几乎刷屏。2020年9月3日,由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)曾嵘研究组、吴家睿研究组与海军军医大学第一附属医院(上海长海医院)张卫研究组联合国科大杭州高等研究院系统生物学重点实验室等在Cancer Cell上发表了题为Integrated Omics of Metastatic Colorectal Cancer的研究论文。 

看到这个文章,小编着实羡慕了一番,大样本量,多组学研究,是组学高水平文章的趋势。同时大样本量,多组学是数据挖掘爱好者必然分析的数据来源。

    小编一直从事各种组学的实验和分析,本期跟大家一起学习一下这篇文章,我们很少有机会去自己准备大量样本做多组学实验,但我们每个做相关领域研究的,都可以去分析数据。在做分子机制研究挑选分子时,通常要找差异表达的基因,蛋白。而这样的大样本正是最佳的数据。TCGA和GEO基本只有RNAseq相关的,缺乏蛋白表达谱和磷酸化表达谱。

主要讨论内容:

(1)结合文献学习多组学联合分析的思路。

(2)作者是如何寻找转移病人独有特征的?

(3)大样本量的文献数据如何在自己的文章中使用?


以下是视频录屏链接,有需要的老师可以观看。

B站 超清链接 :https://www.bilibili.com/video/BV1bf4y1X7qJ

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