单细胞图谱数据库汇总

探序基因,生物信息学解决方案

单细胞数据图谱类数据库汇总:

1. 张泽民团队-肺癌微环境T细胞图谱

http://lung.cancer-pku.cn

使用的是R-shiny来制作的


2. TISCH2 肿瘤

http://tisch.comp-genomics.org/


3.炎症性肠病单细胞水平

http://scibd.cn/


4. DISCO

https://www.immunesinglecell.org

可以按器官查询基因的表达。每种器官的数据源一般来源于GEO数据库,涉及有这种器官的癌症标本,或者疾病标本,但是就是每种器官的单细胞标本并不很多,


5. huarc 单细胞水平克隆型-转录组分析的人类抗原受体数据库

https://huarc.net/database

huARdb:单细胞水平克隆型-转录组分析的人类抗原受体数据库


汇总分析:

2022NAR数据库特刊:单细胞数据库合辑

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