组成蛋白质的氨基酸指的是在翻译过程中作 为原料参与蛋白质合成的氨基酸。在教学过程 中,有些教师将组成蛋白质的氨基酸认为是蛋白质水解得到的氨基酸,这种说法是不正确的。除脯氨酸外,组成蛋白质的氨基酸都可以用结构通式来表示。
组成蛋白质的氨基酸都符合氨基酸的结构通式(脯氨酸例外),但符合结构通式的物质并不一定是组成蛋白质的氨基酸。目前发现的组成蛋白质的氨基酸只有22种,它们的R基都是确定的。 所以,要正确认识组成蚩白质的氨基酸,避免命题错误和教学失误。
氨基酸侧链基团上的氨基和羧基能发生脱水缩合反应,但不常见。例如,还原型谷胱甘肽就是 用谷氨酸的侧链羧基与半胱氨酸和甘氨酸缩合成 的一种三肽。再如,生物素-赖氨酸生物胞素复合物就是生物素和赖氨酸侧链氨基缩合成的化合物。但是,在核糖休进行蛋白质合成时,不会用侧链缩合。这是由酶的专一性决定的。负责氨基酸活化的氨酰tRNA合成酶不会与侧链反应,形成肽键的转肽酶也不识别侧链。
一个氨基酸的a羧基与另一氨基酸侧链上的氨基,或者一个氨基酸侧链上羧基与另一氨基酸上的a氨基,能发生分子间的缩合,形成异肽键。 异肽键就是氨基酸之间不是以a-氨基和a羧基,而是以至少有一个a氨基或a-羧基参与形成的酰胺键。
由此可见,肽、多肽和蛋白质与双缩脲试剂反应呈现的结果是复杂而多样的。在碱性条件下,双缩脈与Cu结合生成紫色络合物;二肽虽然没有类似双缩脲的两个肽键。但因其分子结构中有能与Cu五结合的基团,它们同样能与Cu结合生成相应络合物;多肽虽然都有两个以上的肽键.但它们分子结构的差异使得其与Cu结合的情况各不相同,生成的络合物千差万別,溶液颜色也并不一 定呈现紫色;蛋白质分子与双缩脲试剂产生紫色反应比较明显一致。这些反应的结果差异,是因为不同物质结合的Cu的数量以及生成的络合物的分子结构有明显差异.使得溶液的吸收光谱不同, 进而导致溶液呈现不同颜色。
综上所述,双缩脲试剂并不能用于鉴定所有的 具有两个以上肽键的化台物,有些多肽与双缩脲试剂反应并不呈紫色,许多二肽也能与双缩脲试浏反应,只是不属于双缩脲反应,结果也通常不是紫色。