1.数据库的获取,其中NR,swissprot,go数据库是可以免费下载获得,KEGG数据库是明确需要收费的。2011年最后一个公开的免费版本。KOG还没注意。
2.虽然KEGG本地数据库注释收费,但是可以通过R包,在线注释相应的蛋白。最好的办法还是爬虫下来。(可能有法律风险)
3.以上计划,一个一个慢慢做。先从最简单的GO开始。利用interproscan即可。
1.数据库的获取,其中NR,swissprot,go数据库是可以免费下载获得,KEGG数据库是明确需要收费的。2011年最后一个公开的免费版本。KOG还没注意。
2.虽然KEGG本地数据库注释收费,但是可以通过R包,在线注释相应的蛋白。最好的办法还是爬虫下来。(可能有法律风险)
3.以上计划,一个一个慢慢做。先从最简单的GO开始。利用interproscan即可。