数据结构
准备工作
（1）R的赋值符号 <-
（2）控制台输命令，相当于Linux的命令行
（3）R的代码都是带英文括号的
（4）getwd() #显示工作路径
（5）向量由元素组成，元素可以是数字或者字符串。
（6）表格在R语言中改名叫数据框
（7）别只复制代码，要理解代码的意思。??read.table #查看帮助，example。
（8）数据类型（重点只有两个，剩下的不看）
向量（vector）👈重要
矩阵（Matrix）
数组（Array）
数据框（Data frame）👈重要
List
一、向量
1.标量和向量的区分
元素：数字、字符串（用chr表示）等
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
赋值：赋予这个变量一个数值/字符串/数据框
PS：多次赋值以最后一次赋值为准
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
2.从向量中提取元素
（1）根据元素位置
x是刚才赋值的变量名，根据情况修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
（2）根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
ps：a=3 #赋值，将3赋值给a这个变量，但该变量不会被保留。
a==3 #等于，a的值等于3
二、数据框
1.读取本地数据
（huahua.txt示例数据，一定要放在工作目录里，否则报错。）
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
sep = "\t" #用空格分隔每行上得值
header =T # 将变量名作为第一行
2.设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #将 doudou.txt 赋值为X
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值行名是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #将第一列列名修改为bioplanet
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)
row.names=1 #修改第一列为行名
3.数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
4.变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量
load("test.RData") #再次使用RData时的加载命令
5.提取元素
X[x,y] #第x行第y列
X[x,] #第x行
X[,y] #第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b] #第a列到第b列
X[c(a,b)] #第a列和第b列
X$a #第a列（不用打括号，但是只能提取一列）
6.【选修部分】直接使用数据框中的变量
提取某两列作散点图：
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)
PS:如何减少数据框名a的搜索次数？
法1：attach
将数据框名加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只输列名(连$都不用了)。
attach(a)
plot(case,values)
detach（a）#做完将a删除出搜索环境
局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。
法2：with
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x
Q：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
可能数据框命名为小写字母x或其他名字，需先将数据框命名为X再保存。
脚本的使用和保存：
保存到工作目录下，本文件的后缀就是R，在R语言里还是很在意后缀的。
