一种多个分类变量方差分析结果的可视化方法

在统计分析中,往往会对三个及以上类别的个体在某连续变量上的值进行差异比较,这时候要用到方差分析的方法。通过比较组间均方与组内均方的比值是否超越F分布的临界值而得出组间差异是否显著的判断,是一种常用的假设检验的统计方法。

在学术论文中,方差分析的结果一般用表格的形式表示:

SPSS中单因素方差分析结果表

上图表示的是只有一个类别变量且只有一个连续变量时的结果呈现方式。
然而,某些情况下,需要呈现多种类别变量在多个连续变量上方差分析的结果。假设有M个类别变量和N各连续变量,那么按照上图的形式,至少得用M×N个表才能表示全部结果。为了清楚地展示方差分析结果,可以考虑只表示F值的检验情况,将所有F值的检验结果用一张简洁的图表示清楚。
于是我使用Python语言实现了下面这样的效果:
多个分类变量方差分析结果可视化

图中纵坐标表示了四个类别变量,横坐标表示了十个连续变量。
图中红色圆圈表示的是圆圈对应的纵坐标的类别变量的不同类别个体在对应横坐标的连续变量上的差异显著,以及对应的F值大小,而蓝色“X”表示的是不显著的方差分析结果。
这样的一张图就将40个方差分析的结果表示出来。

上图的代码如下:

# 引入数据分析需要用到的包
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns


categories = ['年龄','性别','人种','地区']
dimensions = ['dim1','dim2','dim3','dim4','dim5',
              'dim6','dim7','dim8','dim9','dim10']
marks = np.random.randn(4,10)+4  # 为了方便,生成随机数作为F值
df_trial = pd.DataFrame(data=marks,index=categories,columns=dimensions)
# 定义一个dataframe的数据表,存放方差分析的F值

# 设置绘图的画布
plt.rcParams['font.sans-serif'] = 'SimHei' # 设置字体
plt.figure(figsize=(12,6)) # 设置画布大小
color_p = sns.color_palette('hls',2) # 设置要用到的颜色
#设置显著的F值对应的类别变量和连续变量的序号,
#其中signif_xy的键代表类别变量的序号,值代表连续变量的序号。
signif_xy = {
             0:[2,3,4],
             1:[4,5,6],
             2:[7,8,9],
             3:[1,3,8,8]
} 

# 开始绘图
for i in [0,1,2,3]:
    for j in [0,1,2,3,4,5,6,7,8,9]: #通过嵌套循环对40个结果对应在图中的位置进行绘制
        if j in signif_xy[i]:
            dot_number = df_trial.iloc[i,j]
            plt.scatter(x=j+1,y=i+1,marker='o',s=(dot_number-1.5)**2*50,color=color_p[0],alpha=0.5)
            plt.text(x=j+1,y=i+1-0.22,s='{0:.3f}'.format(dot_number),fontsize=12,va='center',ha='center')
        else:
            plt.scatter(x=j+1,y=i+1,marker='o',edgecolors='black' ,s=4**2*20,color="white",alpha=1)
#             plt.text(x=j+1,y=i+1,s='{0:.3f}'.format(dot_number),fontsize=12,va='center',ha='right')
plt.xticks([1,2,3,4,5,6,7,8,9,10],dimensions,fontsize=16)
plt.yticks([1,2,3,4],categories,fontsize=16)
plt.ylim((0.5,4.5))
# plt.legend(['a','b','c','d','e','f','g','i','j','k','l','m','n'])
plt.show()

这样就得到了一个用点的大小表示的方差分析结果图。是不是还算简洁美观呢?
当然还可以根据自己的偏好,改变可视化的风格,比如改变颜色:


更换图标颜色与形状

关于颜色的使用可参考这篇文章:Matplotlib作图常用marker类型、线型和颜色

关于如何使用seaborn包实现丰富的配色方案可参考这篇文章:绘制热力图seaborn.heatmap,cmap设置颜色的参数

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,723评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,003评论 3 391
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 161,512评论 0 351
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,825评论 1 290
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,874评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,841评论 1 295
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,812评论 3 416
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,582评论 0 271
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,033评论 1 308
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,309评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,450评论 1 345
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,158评论 5 341
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,789评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,409评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,609评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,440评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,357评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容