DAY2——清芷

0成本召唤Linux

Linux是个啥?

就是一个类似于Windows和mac的操作系统。

Linux应用

  • 主要应用于服务器(supercomputer),服务器可以支持多个用户同时使用而不会相互干扰,彼此之间的权限控制相互独立,不同的用户权限不会被他人控制。
  • 不同于Windows的图形界面,Linux的操作要靠命令行来实现。类似如下:
    Linux命令行
  • 目录结构:
    目录就是Windows的文件夹,不同于Windows习通,Linux系统没有C/D/E/F盘,文件系统呈树状。由于用户权限限制,每个用户只可以访问自己相应的“宿主目录”

学Linux对生信的帮助

生信的软件都基于Linux,开源、免费的系统可以有效地节约资源,命令行模式可以高效、批量地处理数据文件。当你面对几十个G的数据时,Windows系统容易崩。

如何召唤Linux?

“Microsoft love Linux”
win10 系统已经内置了Linux而非虚拟化,可以直接在应用商店下载。

如何下载?

  1. 设置-更新和安全-针对开发人员-启用开发人员模式
  2. 控制面板-控制面板-程序-启动或关闭Windows功能-适用于Linux的Windows子系统
  3. 重启
  4. 下载Ubuntu
  5. 启动ubuntu和用户设置
  6. 更新
    输入sudo apt update
    完成后输入sudo apt upgrade
    sudo 代表管理员,apt相当于install(安装)

下载和安装了更新,就可以投入使用啦。但是这只是可以满足你的基本学习Linux的操作,如果需要实战处理数据就需要服务器。也可以远程登陆服务器,下载一个免安装软件putty,配合IP地址和用户名就可以登陆了。

终于开始Linux的学习

Linux的指令和选项:

  • 指令:在Linux终端(命令行)中输入的内容就称作指令
  • 一个完整的指令标准格式:
    #[指令主体][选项][操作对象]
    例如,让张山同学帮忙在楼下一瓶农夫山泉,在这个指令中,买东西是指令的主题,买的水是操作的对象,农夫山泉是操作的选项

Linux的基础指令:

  1. pwd指令:
    print working directory 显示当前路径


    pwd
  2. mkdir: make directory新建一个空目录

  3. ls:显示列表的目录和文件


    ls
  4. rm:删除
    根据删除对象的不同分成三类

  • 删除文件--rm
  • 删除空目录--rmdir
  • 删除非空目录--rm -r
    其中 -r递归:一并删除多级目录
    -f:强制删除
  1. cd后面接一个目录名,表示进入该目录
    cd -直接返回刚才过来的目录
    注意空格!!!
    要返回主目录直接cd
    操作练习(删除、进入、返回)
  2. vi:新建脚本或者是文本编辑器
    vi
  3. 查看文本文件:
    cat:接上本文件的名字可以查看文本文件的内容
    head默认输出前十行,tail默认输入后十行,后面加上-n自定义输出几行.
    cat
  4. 复制
    cp file1 file2 复制file1 命名为file2
    cp

    遇到的问题及解决办法
    cp: omitting directory
  5. mv
    将文件移入文件夹,或者重命名
  • mv file 路径 移动file到某个路径下面
  • mv file1 file2 将file1 重新命名为file2
    重命名和移动

linux文件名自动补全

文件名自动补全实操

问题解决

  1. ls输出的是横向的列表,怎样输出长格式列表?
    Linux命令大全
    在ls 命令之后加上选项 -l

    ls -l

  2. 如何查看长格式列表中文件的大小?


    ls -lh
  3. 查看Linux的系统版本、内存和硬盘空间。
    系统版本xshell6


    硬盘空间查看用df-h

    各项分别代表 文件系统 容量 已用 可用 已用%% 挂载点


    内存查看用free
  4. 如何建立类似/tmp/tmp1/tmp1.1这样的层级目录?

    层级目录的建立

  5. 如何删除层级目录?
    rm -r表示递归处理,将指定目录下的所有文件和子目录一起处理掉
    当文件中含有子目录时,不可以直接rm删除
    一旦删除就不可以再恢复

    谨慎使用!!!

    rm选项

    层级删除

小结

  • 当一个指令出问题的时候,可以检查一下格式有没有错,空格很容易漏。

  • 遇到不懂的问题,或者显示错误,可以在Linux的语法库搜索对应的指令,看看相应的选项,在提问之前先自己动脑思考一下。

  • 有点累,但是挺开心的。


    思维导图
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