PyMol3.0.3的安装

PyMOL 是一款广泛用于分子可视化和结构生物学的开源软件，主要用于展示和分析蛋白质、核酸等生物大分子的三维结构。它由 Warren Lyford DeLano 开发，现由 Schrödinger 公司维护和管理。PyMOL 基于 Python 构建，结合图形界面和命令行操作，支持高质量图像渲染和动画制作，深受科研人员青睐。

目前已发布版本分为：

1. PyMOL 1.x 系列
   发布时间: 早于 2010 年左右，最后一个主要版本为 1.8.x（2015 年左右）。
   特点:
   这是 PyMOL 的经典版本，基于 Python 2.x 开发。
   提供基本的分子可视化功能，如结构显示、表面渲染和简单的脚本支持。
   开源社区维护广泛，插件生态丰富（如 APBS 电势计算）。
   渲染质量较好，但缺少现代化的光线追踪和高性能优化。
   适用场景: 老旧系统或依赖 Python 2 的用户仍在使用，但逐渐淘汰。
   限制: 不支持 Python 3，缺乏新功能和技术支持。
2. PyMOL 2.x 系列
   发布时间: 2017 年起，2.0 为重大更新。
   特点:
   迁移到 Python 3，支持现代开发环境。
   改进用户界面（可选 Qt 支持），增强脚本功能和跨平台兼容性。
   渲染引擎优化，支持更高分辨率输出，部分版本引入光线追踪改进。
   开源版和商业版同步更新，商业版提供额外高级功能（如分子编辑工具）。
   适用场景: 当前学术和工业用户的主流选择，适合需要 Python 3 集成的科研工作。
   限制: 开源版安装可能仍需手动配置，部分老插件需更新以适配。
3. PyMOL 3.x 系列
   特点:
   进一步优化性能，如 GPU 加速渲染。
   增强 AI 集成（如对接模拟或结构预测工具）。
   更现代化的界面和用户体验改进。

本文介绍PyMol3.0.3版本的安装。界面语言为英文，安装环境建议win10或更高，系统位数为64位。

PyMol

1. 下载安装包，并解压；

   
   

2. 以管理员身份运行；

   
   

3. 正常安装即可。注意：安装地址需要为默认地址
   

4. 等待安装完成；

   
   

5. C盘下找到ProgramData（若找不到，需要查看隐藏文件）

   
   
   
   

6. 找到PyMol文件夹后，将下载的安装包中两个文件移动至C盘下PyMol文件夹中覆盖原文件；

   
   
   
   
   
   

7. 打开PyMol软件，导入.lic许可证，以供长久使用。
   

   打开Pymol

上传许可证

导入成功

安装成功

注：软件的安装包请关注“队长的生物实验室”获取。