ggplot2 day4

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,shape=sex,color=sex))+geom_point()+scale_shape_manual(values=c(1,2))+scale_color_brewer(palette="Set1")

image.png

heightweight$weightgroup <-cut(heightweight$weightLb,breaks=c(-Inf,100,Inf),labels=c("<100",">100"))#添加新的一列weightgroup,将其根据weightlb的值分为两类 ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,shape=sex,fill=weightgroup))+geom_point()+scale_shape_manual(values = c(24,21))+scale_fill_manual(values=c(NA,"black"),guide=guide_legend(override.aes = list(shape=21,size=3)))#根据weightgroup决定是否填充,图例的设置利用guide_legend函数,使用override.aes函数可以对多种性质进行设置
image.png

图例的相关设置:
theme(legend.title = element_text(size=15, color = "firebrick"), #图例标题的相关设置

当设置为theme(legend.title=element_blank())时,表示删除图例的标题。

      legend.text = element_text(size=10),      ###  图例文本的设置

      legend.position=c(0.95, 0.05),###图例位置,可设置坐标值,也可是'top','bottom','left','right'。默认为right

      legend.key=element_rect(fill='green'))    ###  图例的符号,设置后填充的形状可与绘图对象设置的形状保持一致。file表示填充色。

legend.background=element_rect(colour="purple",fill="pink",size=3,linetype="dashed")

图例形状大小的设置: + guides(colour = guide_legend(override.aes = list(size=5)))

去掉Legend两种方法:1,+NoLegend() 2, +theme(legend.position='none')

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,size=weightLb))+geom_point()+scale_size_continuous(range =c(0.5,3) )#连续型变量也可映射到颜色或者大小上,其中大小界限可以自行决定

image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,fill=weightLb))+geom_point(shape=21,size=2.5)+scale_fill_gradient(low="black",high="white")#如果shape选择了有边框线的,可以将连续型变量映射到fill
image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,fill=weightLb))+geom_point(shape=21,size=2.5)+scale_fill_gradient(low="black",high="white",breaks=seq(70,170,by=20),guide = guide_legend())#use guide_legend() to replace the continuous color bar by discrete color bar.
image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,size=weightLb,colour=sex))+geom_point(alpha=0.5)+ scale_size_area()+#使数据点和面积成正比 scale_colour_brewer(palette = "Set1")
image.png

ggplot(diamonds,aes(x=carat,y=price))+geom_point(alpha=0.1)#通过调整透明度解决图形重叠的问题
image.png

ggplot(diamonds,aes(x=carat,y=price))+stat_bin2d(bins=50)+scale_fill_gradient(low="lightblue",high="red",limit=c(0,6000))#,使用箱型来解决图形堆积,调用limit函数手动将范围设定到最大值6000
image.png

添加拟合曲线

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point()+stat_smooth(method = lm)#默认情况下会添加95%置信度,可以用level函数手动设置

image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point()+stat_smooth(method = lm,level=0.99)
image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point()+stat_smooth(method = lm,se=FALSE)#无置信度
image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point(colour="grey60")+stat_smooth(method = lm,se=FALSE,colour="black")#看上去清楚一点
image.png

ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point()+stat_smooth(method=loess)#默认情况采取loess曲线(局部加权多项式)
image.png

最基础的做法,首先建立模型(根据所需的方法),再使用predict()函数做出预测,得到大量预测点,绘图

model<-lm(heightIn~ageYear+I(ageYear^2),heightweight)#建立模型 model xmin<-min(heightweight$ageYear) xmax<-max(heightweight$ageYear) predicted<-data.frame(ageYear=seq(xmin,xmax,length.out = 100))#在最小值和最大值之间取100个值 predicted$heightIn<-predict(model,predicted) predicted ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point(alpha=0.1)+geom_line(data=predicted,size=1)#运用模型绘出线条

image.png

也可使用predictvals()函数

predictvars<-function(model,xvar,yvar,xrange=NULL,sample=100,...){
  if (is.null(xrange)){
    if (any(class(model)%in% c("lm","glm")))
      xrange<-range(model$model[[xvar]])
    else if (any(class(model) %in% "loess"))
      xrange <- range(model$x)
  }
  newdata<-data.frame(x=seq(xrange[1],xrange[2],length.out = sample))
  names(newdata)<-xvar
  newdata[[yvar]]<-predict(model,newdata = newdata,...)
  newdata
}

利用上述公式建立Logistic回归,需要加上type="response",因为默认情况下改函数返回的结果是线型的

model<-glm(classn~V1,b,family = "binomial")
glm_predicted<-predictvars(model,"V1","classn",type="response")                 
ggplot(b,aes(x=V1,y=classn))+geom_point(position=position_jitter(width=0.3,height=0.06),alpha=0.4,shape=21,size=1.5)+geom_line(data=glm_predicted,color="black",size=1)
image.png
make_model<-function(data){
  lm(heightIn~ageYear,data)
}#创建构建模型函数,供后续的dlply函数中使用
models<-dlply(heightweight,"sex", make_model)#dlply函数可将数据框根据某项分割为多部份
models
predvals<- ldply(models,.fun=predictvars,xvar="ageYear",yvar="heightIn")#ldply函数可将分成几部分的数据框一起进行函数处理
predvals 
ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,colour=sex))+geom_point()+geom_line(data=predvals)

image.png

在以上的图中加文字,如模型系数
ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,colour=sex))+geom_point()+geom_line(data=predvals)+annotate("text",label="111",x=16.5,y=52)
image.png

数学公式可以用parse=true来实现
ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,colour=sex))+geom_point()+geom_line(data=predvals)+annotate("text",label="x^2",parse=TRUE,x=16.5,y=52)

image.png

添加边际地毯,记录相邻两次的间隔时间
ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn,colour=sex))+geom_point()+geom_line(data=predvals)+annotate("text",label="x^2",parse=TRUE,x=16.5,y=52)+geom_rug()
image.png

若添加扰动减少线宽效果更佳
ggplot(faithful,aes(x=eruptions,y=waiting))+geom_point()+geom_rug(position="jitter",size=0.2)

image.png

气泡图

cdat<-subset(countries,Year==2009&Name %in% c("Canada","Ireland","United Kindom","United States","New Zealand","Iceland","Japan"))
ggplot(cdat,aes(x=healthexp,y=infmortality,size=GDP))+geom_point(shape=21,colour="black",fill="cornsilk")+scale_size_area(max_size = 10)+xlim(1000,10000)+ylim(0,10)
image.png
最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 213,014评论 6 492
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 90,796评论 3 386
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 158,484评论 0 348
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 56,830评论 1 285
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 65,946评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,114评论 1 292
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,182评论 3 412
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 37,927评论 0 268
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,369评论 1 303
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 36,678评论 2 327
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 38,832评论 1 341
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,533评论 4 335
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,166评论 3 317
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 30,885评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,128评论 1 267
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 46,659评论 2 362
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 43,738评论 2 351