1.BiocManager升级自己
BiocManager::install(version = "3.11")
2.升级R包
update.packages("S4vectors")
update.packages() #更新已经安装的包
3.参看软件版本
packageVersion("S4vectors")
4.利用Y叔的rvcheck查看包版本,升级R包
install.packages("rvcheck")
library(rvcheck)
check_r()
check_bioc('ggtree')
check_cran('emojifont')
check_github("GuangchuangYu/clusterProfiler")
update_all() #更新所有的CRAN、Bioconductor、Github R包
参考:https://www.jianshu.com/p/ef919437835e
老来多健忘,唯不忘相思。。。。
R-安装、卸载、查看及卸除加载包
1. 安装包#
install.packages("BiocInstaller")
2. 卸载已安装包#
remove.packages("BiocInstaller")
3. 查看已加载包#
(.packages())
4. 卸除已加载包#
detach("package:BiocInstaller")
5. 查看已安装的包#
installed.packages()
6. 查看某个安装包提供的函数#
help(package="BiocInstaller")
7. 查看某个函数属于哪个包#
help("biocLite")