markerdata$celltype <- factor(x=markerdata$celltype,
levels = c("Endothelial","Fibroblast","Epithelial","Immune","Other"))
DoHeatmap(markerdata,
features = as.character(unique(markers$markers)),
group.by = "celltype",
assay = 'RNA',
group.colors = c("#00BFC4","#AB82FF","#00CD00","#C77CFF"))+
scale_fill_gradientn(colors = c("white","grey","firebrick3"))
marker基因热图绘制
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