2021-07-07 RBP知多少

        RNA作为遗传信息传递与调控分子,在各种细胞生命活动中发挥着至关重要的作用。细胞中,RNA合成、加工、转运、翻译、降解以及功能发挥都需要有蛋白质的直接参与,这类与RNA直接结合的蛋白质就称为RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)[1]。RBP通过其RNA结合域(RNA-binding domain,RBD)直接与RNA结合,以核糖核酸蛋白复合物(Ribonucleoprotein,RNP)的形式,参与细胞生命活动调节。

        截止目前,各种方法鉴定的RBP有3470个,其中有1777个RBP预测具有RBD,而其中859个是被实验验证具有RNA结合能力的RBD[2]。针对RBP的系统分类尚未形成广泛共识。有按照RBP具有的RBD进行分类,例如按照常见RBD,RNA recognitionmotif (RRM),K-homology(KH),DEAD/DEAH helicase和Zinc-finger domain等分成不同RBP家族[3];或者按照RBP结合的RNA类型分成:mRNA结合的RBP,pre-rRNA结合的RBP,tRNA结合RBP,snRNA结合RBP,snoRNA结合RBP和ncRNA结合RBP等[4]。

Reference

[1].        Hentze MW, Castello A, Schwarzl T, etal. A brave new world of RNA-binding proteins. Nat Rev Mol Cell Biol, 2018, 19:327-341

[2].        Gebauer F, SchwarzlT, Valcárcel J, et al. RNA-binding proteins in human genetic disease. Naturereviews Genetics, 2021, 22: 185-198

[3].        Liao J-Y, Yang B,Zhang Y-C, et al. EuRBPDB: a comprehensive resource for annotation, functionaland oncological investigation of eukaryotic RNA binding proteins (RBPs).Nucleic Acids Res, 2020, 48: D307-D313

[4].        Gerstberger S,Hafner M, Tuschl T. A census of human RNA-binding proteins. Nat Rev Genet,2014, 10.1038/nrg3813

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 219,366评论 6 508
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 93,521评论 3 395
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 165,689评论 0 356
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,925评论 1 295
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,942评论 6 392
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,727评论 1 305
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,447评论 3 420
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 39,349评论 0 276
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,820评论 1 317
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,990评论 3 337
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 40,127评论 1 351
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,812评论 5 346
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,471评论 3 331
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 32,017评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 33,142评论 1 272
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 48,388评论 3 373
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 45,066评论 2 355

推荐阅读更多精彩内容