物种形成事件往往发生在快速爆发多样化的时期，但是促进这些辐射的生态和遗传因素仍存在很大的争议。使用所有的13个物种在生态上和生殖上多样化的野生番茄分支的转录组，我们推断了物种的系统发生和遗传多样性模式。由于祖先变异的sorting不一致，导致广泛的系统发育不一致，我们将这种辐射的起源确定为大约2.5个百万年，并发现了至少三种可促进多样化的适应性遗传变异的证据。首先，我们探测到了基因渐渗，其次，我们发现很多基因区系特异从头进化的证据。最后，使用PhyloGWAS的方法，我们检测了来自不同物种但共享共同环境条件的群体间特定环境下的祖先变异。通过对整个支系的估计，基因组的纯色部分被推断为这三种适应性遗传变异来源中的每一种都有微小但实质且大致相等的部分。这些结果表明，在新的生态机会下，多种遗传来源可以促进物种快速多样化和形成，这与我们对古代和近代物种辐射复杂性的系统基因组学的理解是一致的。
不是很明白，继续读读吧。
文献来源：
Phylogenomics Reveals Three Sources of Adaptive Variation during a Rapid Radiation 2016年的Plos Genetics
