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  • 小麦育种历史揭示了植株构型和籽粒产量多性状基因组位点的协同选择

    作物种质的多样性调查对于深入了解植物结构和谷物产量提高的基因组基础非常重要,这在小麦中仍然知之甚少。在这里,我们对过去 100 年收集的 287...

  • 非同源染色体配对:序列相似性还是遗传控制?

    多倍体必须正确地分离同源染色体。我们认为,这一过程不仅是由序列相似性决定的,而且还受到强大的遗传控制,这可能在不同的世系之间有所不同。我们还强调...

  • Inspector--准确的长读从头组装评估

    长读从头基因组组装继续快速发展。然而,缺乏有效的工具来准确评估装配结果,特别是结构误差。我们提出Inspector,一个无参考的长读从头组装评估...

  • 植物基因组测序二十年:成就与挑战

    在过去的20年里,已经公布了1000多个植物基因组的序列,代表了788个不同的物种,具有高度的多样性。采用新型支架策略的长读测序进一步彻底改变了...

  • MBE|比较基因组分析突出转座子介导的基因组扩张和棉花 3D 基因组折叠的进化结构

    转座子 (TE) 扩增已被认为是介导基因组大小扩展和进化的驱动力,但在植物中塑造 3D 基因组结构的后果在很大程度上仍然未知。在这里,我们使用牛...

  • 持续遗传变异的维持:大西洋刺鱼的基因流动与选择中立

    对衍生生境的适应往往是由长期遗传变异(SGV)引起的。遗传变异在祖先群体中的维持通常归因于净化选择和跨生境杂交产生的基因流之间的长期拮抗。基于多...

  • 2021-01-16 实现先按照染色体号排序后按位置坐标排序

    经常会遇到对文件的排序,这里记录一下如何先按照染色体号排序,然后按照坐标位置排序 这里,先按照第一列进行排序,然后第二列按照数字大小从小到大排序...

  • 2021-01-07 服务器linux出现 Read-only file system

    出现这个问题是硬盘只能读,不能写了。解决思路是,先把硬盘unmount,再mount上。不是简简单单的unmount再mount就可以的。在un...

  • 2020-11-04 一篇线虫的端对端基因组组装的文献

    这篇文献可能不是很好理解,现在还没有读完。文献已经存在noteexpress上。 在这篇文章中发现了两个比较好使的工具,记录一下。 1. [AG...