安装Phobius:
http://phobius.sbc.su.se/data.html
tar -xzvf phobius101_linux.tar.gz
cd /mnt/g/ubuntu_software/tmp/tmpbKioAY/phobius
#################################################################
######Error - could not read provided fasta sequences ####################
###Edit phobius.pl L24 to my $DECODEANHMM = "$PHOBIUS_DIR/decodeanhmm.64bit" ##
###################################################################
加入环境变量
vim ~/.bashrc
添加:export PATH=$PATH:/mnt/g/ubuntu_software/tmp/tmpbKioAY/phobius
保存:
:wq!
运行
phobius.pl -h
phobius.pl -short test.fasta > output.file