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张居正是前东林时代的近反派人物，当然万历死后，天启、崇祯年间逐渐给张氏平反的，正是东林人士。
张居正时代，相权达到了一个空前的高度。张本人对官僚系统的权力集中，主要通过（发明实施的）考成法。而绩效考核的金字塔最上端，是六科上面的内阁。这样就把监察纠弹的不稳定斗争工具收在阁臣手里。
言官反击，赵参鲁就事论事、余懋学直指（张）江陵，傅应祯强调应该开言路、刘台批评考成法。自然一个个灰头土脸，都受到了惩戒。
万历5年，张居正父亲去世，夺情与否成为朝廷争辩的引线。张居正除对个别露头的官员廷杖弹压外，还干脆搞了个临时京察，排除了异己。
除了言官的钳制，张居正还相当讨厌士林聚集议论时政，万历七年和八年，毁弃天下书院。举了白鹿洞书院（南康）、白鹭洲书院（吉安）、文江书院（吉安）、复古书院（安福）、恒阳书院（高邑）的例子。邹元标、赵南星这些东林前辈开始发声，反对张居正。
考成法在丈量天下土地中也有不良影响，巡按御史这个临时官衔因考成成了地方常设。申时行作首辅时，考成法罢废。
