一、Miniconda是什么?
Miniconda是一款生信相关的应用商店。
二、Miniconda的安装
1、安装前首先在xshell中使用uname -a
命令查看服务器是多少位的
2、cd biosoft
进入昨天建立的目录
3、wget
加链接下载
4、source ~/.bashrc
激活
5、conda
出现很多信息证明激活成功
6、添加镜像
# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
三、Miniconda的使用
1、conda list
查看软件列表
2、conda search
搜索软件
3、conda install fastqc -y
安装软件
4、conda remove fastqc -y
卸载软件
5、conda info --envs
查看环境