用Ubuntu和RStudio Server搭建一个R语言的云平台

前一段介绍过利用Windows系统的Ubuntu子系统搭建数据科学平台,此番来介绍下除了jupyter之外的另外一个数据科学神器:RStudio Server。同时基于Ubuntu和RStudio Server搭建一个R语言的云平台,用于数据分析。

1 RStudio Server简介

RStudio Server 是 RStudio 公司打造的一款基于 Web 的开源编辑器。在实际的工程中,我们的服务器大多是基于Linux的,比如常见的 ubuntu、centos 等。这些操作系统有时并不提供图形化界面,这时候RStudio的服务器版本就派上用场了。启动RStudio Server后,进入在浏览器中进入某一个页面后就可以像桌面版一样使用RStudio编辑器。当R的代码在服务器上出现bug了,线上的hotfix是在所难免的,这时候就需要用到 RStudio Server。--百度百科。

事实上就是一个Web版的RStudio。

2 R语言云平台搭建

闲话少说,就来搭建平台吧。首先,这次我是在我自己的办公室的工作站上搭建,因此受到局域网限制,我主要是方便于使用办公室的工作站,某种意义上是个伪云平台。如果真的想搭建一个网络访问式的,必须购买服务器。阿里云等都是可以的。其次除了搭建平台外,由于平常主要在做一些空间分析类的处理,因此搭建完成后还会有一个小的样例代码就当是hello world。

事实上平时使用工作站时,通常就是利用笔记本和XShell连接,然后就开始像六指琴魔一样疯狂敲击键盘,尤其是vim之类的编辑器。

image

当然有些时候我们需要所见即所得的分析。因此搭建一个平台的需求就出来了。现在Xshell搭建平台。第一步是事实上是安装基础的R语言。这一步我们之前的博客已经介绍过了,不了解的同学可以看一下这篇博客。

在Ubuntu中安装R的几种方式总结

接着就安装gdebi-core。在Xshell里输入如下代码。

sudo apt-get install gdebi-core
image

接着下载RStudio Server的deb文件。

wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-1.1.447-amd64.deb
image

下载完毕后,用gdebi安装并运行即可。

sudo gdebi rstudio-server-1.1.447-amd64.deb
image

可以输入命令查看后台RStudio Server运行情况。

ps -fel | grep rstudio-server
image

这里不建议用root账户来使用RStudio,类似之前搭建WSL里的数据科学环境,这里添加一个普通用户来使用。

sudo adduser rstudio

接着就需要输入密码,根据自己需求输入密码,这就是等等页面里需要输入的用户和密码。这一步结束之后,可以直接打开对应的IP地址加上8787,RStudio默认在8787端口运行。

http://<server-ip>:8787

http://192.81.132.143:8787/auth-sign-in

image

登陆即可。

image

3 Hello World

当然需求展示一下一个栅格数据。基于raster包,R语言里的神包。因此需要先安装raster,而此包又依赖于rgdal,而rgdal则要求必须安装GDAL。GDAL版本也有要求,因此这一块配置也是个需要花费一些功夫的地方。当然GDAL本身就是一个很棒的开源GIS库。这里就列一下资源。关于GDAL安装配置等以后找个时间专门讲。

library(raster)
filerall <- raster("/home/Workspace/python/Xiamenair/data/pm25halfyear.tif")
spplot(filerall)
image

参考资料:

Configure Rstudio Server on Ubuntu 16.04

Urban Data Science — Ex 1: Tools

python GDAL 2.1 installation on Ubuntu 16.04

python GDAL 2.1 installation on Ubuntu 16.04

How To Install GDAL/OGR Packages on Ubuntu

Rstudio-server的安装与使用

在Ubuntu升级R版本

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 214,951评论 6 497
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,606评论 3 389
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 160,601评论 0 350
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,478评论 1 288
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,565评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,587评论 1 293
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,590评论 3 414
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,337评论 0 270
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,785评论 1 307
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,096评论 2 330
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,273评论 1 344
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,935评论 5 339
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,578评论 3 322
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,199评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,440评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,163评论 2 366
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,133评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容

  • 习惯性起床后去欢儿房间小睡一下,眼看今天天气放晴,探讨这着可以去上早教课,姥姥跟我描述前几天她上课的情景。她睡眼朦...
    欢欢乐乐1317阅读 228评论 0 0
  • 纸:宝虹中粗300g 笔:黑天鹅、达芬奇v35 颜料:史明克、辉柏嘉彩铅 先看完成图 慢慢的摸索中吧 感谢您的喜欢!
    暖七_sj阅读 283评论 0 6
  • 七点十分被电话铃声吵醒,丫头让开门,嘴里嘟噜了两句,还是起床开了门。看她回家一脸的开心,没有和她计较,免得破坏大家...
    MM妙慧阅读 164评论 1 2