化学合成必备工具:推荐几个实用的化学反应数据库

化学反应数据库对于实验人员设计合成路线具有很高的价值,尤其在有机化学领域中显得尤为重要。

化学反应数据库作为化学研究和工业应用中不可或缺的资源,不仅极大地提升了实验人员设计合成路线的效率,促进了化学知识的积累与传承,还激发了创新思维,推动了化学科学的进步,同时为教育工作者和学生提供了丰富的学习材料,帮助企业优化生产流程,开发新产品,并通过安全性评估减少了实验风险,促进了跨学科的研究与合作,支持了数据驱动的科学决策,加强了国际间的学术交流,鼓励了全球范围内的知识共享与合作,对化学及相关领域的研究和发展产生了深远的影响。

本文推荐以下几个反应数据库

1、Reaxys数据库

【网址】:https://www.reaxys.com

Reaxys数据库是目前最大的化学数据库,其收录的数据范围涵盖有机合成、药物化学、天然产物化学、无机化学和金属有机化学,并将化学反应,化合物物性数据,合成线路设计进行无缝对接,使科技检索工作更加高效、精准,并以其强大的检索功能和深入的核心信息摘录为化学研究注入新的生机。

Reaxys 将十多亿个化学数据点与人工智能相结合,为药物发现、化学研发和学术界的创新提供支持。化学家可以快速获取相关的专利、物质和生物活性见解以及屡获殊荣的逆合成工具。Reaxys在Beilstein基础上整合了盖墨林(Gmelin)和专利化学数据库(PCD)以及化学相关期刊的内容,能帮助科研人员快速全面地查询化合物的理化数据,设计经济、高效的合成路线,最大程度节省时间和资金成本。

其收录的数据范围涵盖有机合成、药物化学、天然产物化学、无机化学和金属有机化学,并将化学反应,化合物物性数据,合成线路设计进行无缝对接,使科技检索工作更加高效、精准,并以其强大的检索功能和深入的核心信息摘录为化学研究注入新的生机。在进行结构式检索时,Reaxys 提供了多种检索模式和工具,以帮助用户精确地找到所需的化合物和反应信息。

2、CAS SciFindern数据库

【网址】:https://scifinder-n.cas.org

CAS SciFindern由美国化学会(American Chemical Society, ACS)旗下的美国化学文摘社(Chemical Abstracts Service, CAS)出品,是一个研发应用平台,提供全球最大、最权威的化学及相关学科文献、物质和反应信息。综合了全球200多个国家和地区的60多种语言的1万多份期刊,内容丰富全面,用户可以通过主题、分子式、结构式和反应式等多种方式进行检索。

该平台汇集了180多个国家、50多种语言出版的文献及64家专利授权机构的专利,包含5900万化学及相关学科文献、2.04亿化学物质、1.5亿化学反应、139万来自专利的马库什结构、化学品商业信息及管控信息,最早回溯至1840年。

CAS SciFindern的一大特色是可以提供专利马库什结构的机构。平台从全球64家专利机构的公开专利中提取了超过139万个可检索的马库什结构,一个马库什结构可能涵盖数千甚至数万个化合物,这大大增强了研发和知识产权专业人士在进行化合物结构的新颖性和创造性搜索、发现相似专利以及评估潜在侵权风险的能力。并且其中的CAS PatentPak模块在定位和分析大量专利中的化学结构方面,采用人工标引,检索人员可以快速识别专利中难以发现的物质(例如,表格化合物和图形图像内的化合物)。

平台的另一特色是其含有7.2亿生物序列,可进行FTO检索、侵权检索,可以更好的服务与研发人员及知识产权相关行业人士。CAS SciFindern数据库中还包括一个反应信息数据库CASReact,收集了各种反应与制备信息。

3、ORD

【网址】:https://github.com/open-reaction-database

0RD(Open Research Dataset)是由亚马逊推出的一个免费开放的科学研究数据集。一种用于构建和共享有机反应数据的开放访问架构和基础设施(包括一个集中的数据存储库)。它包含超过2000万个科学论文摘要和全文的数据,覆盖了计算机科学、物理学、数学、生物学、医学、化学等多个学科领域。

ORD的目标是提供给研究人员一个大规模的数据集,以便他们进行深入的研究和分析。

ORD 搜索界面用于在数据库中搜索反应。可以通过输入或输出分子的 SMILES/SMARTS 子结构、反应 ID、出版物 DOI 等查询反应。每个反应都有一个摘要页面,其中显示了完整记录以及图形示意图。我们还编写了一个简单的Python API,使下游用户能够以编程方式轻松访问数据。客户端库支持基于Web的搜索界面中的所有搜索功能,以及下载完整数据集或反应列表的功能。

解析ORD数据集时,你可以按照不同的科学领域进行分类,选择你感兴趣的领域进行研究。你可以使用关键词功能,快速找到和你研究主题相关的论文。在使用ORD进行科学研究时,你可以使用机器学习和自然语言处理的技术对数据进行分析。除此之外,你还可以使用其他的数据分析方法进行研究。

4、MolAid

【网址】:https://chem.molaid.com

MolAid作为国内领先的多终端化合物检索及智能一体化数字合成平台,收录全球数以亿计的化合物数据,提供精准数据信息。MolAid打破化学数据垄断,让用户摆脱数据库不稳定、高查询成本等烦恼,为中国科研工作者提供专业的物质查询、反应检索,助力中国化学合成发展。

MolAid为用户提供多种查询化合物信息方式,包括通过名称、CAS、化学式或者SMILES等常用编码进行搜索,还支持绘制结构以及高级检索方法(比如:谱图反向查询化合物、晶体信息反向查询以及根据化合物物化性质等特征信息进行逻辑符连接)。

MolAid多样的化合物检索方式,确保用户每次一检索都能获取有价值的信息。为我们提供化合物作为反应物、产物、试剂、溶剂及催化剂的所有已发表文献和专利中的反应信息,使我们能够清楚快捷的查询到需要的反应信息及期刊信息。

考虑到每个实验室条件,设备及贮存的化合物不同,MolAid他们将反应物、产物、溶剂、试剂、催化剂、产率、年份、来源等数据均做了聚类处理,方便我们更快捷的找到反应中适用的化合物。

5、chemspider

【网址】:ChemSpider | Search and share chemistry

ChemSpider是由英国皇家化学会(RSC)提供的一个免费化学物质数据库,收录1亿多种化学品的信息,包括其结构、物理化学性质、生物学性质、2D和3D结构示意图、物质合成的路线、参考文献等多种信息,可下载mol格式的结构源文件等。 ChemSpider通过聚合多个来源的数据,提供了一个广泛的化学物质检索平台,对科研人员和教育工作者比较有用。现在,该数据库含有的信息包括海洋天然产物数据、ACD实验室化学数据库、EPA的DSSTox数据库以及来自不同供应商的一系列化学物质信息。数据库拥有多种搜索工具,而且大多数化合物都有计算物理化学性质值的。

ChemSpider中收录了数百万种有机、无机和生物分子的结构、属性和相关信息。用户可以通过搜索、浏览和互动来获取有关化合物的详细信息,包括分子结构、物理化学性质、光谱数据、毒性信息等。这个平台可以帮助研究人员在化学研究、药物开发、环境科学等领域找到所需的数据和信息。

数据库提供以下查询方式:标准查询方式包括系统名称、商业名称和同义词、登记号查询;高级查询方式提供互动式搜索,通过化合物结构、化合物子结构,分子式以及分子量、CAS编号搜索。

其他

查询合成路线/人名反应 还有以下网站:

https://www.nextmovesoftware.com/about.html

http://www.stolaf.edu/depts/chemistry/courses/toolkits/247/practice/medialib/data/

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

http://www.organic-chemistry.org/reactions.htm

http://chemistrybydesign.oia.arizona.edu/

https://organicchemistrydata.org/hansreich/resources/syntheses/

https://www.masterorganicchemistry.com/reaction-guide/

这些数据库专门收集和整理了化学反应信息的在线资源,通常包含反应物、生成物、反应条件、催化剂、反应机理、产率等详细信息,对于化学研究和教育具有重要价值。

希望以上推荐对你有所帮助~

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