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看分布数目：
table(a[,8] == "RNA-Seq");返回行号：
which(a[,8] == "RNA-Seq")或者grep("RNA-Seq",a[,8]（grepl("RNA-Seq",a[,8]返回T或F）；获取行：
b<-a[which(a[,8] == "RNA-Seq"),]或者b<-a[a[,8]=="RNA-Seq",]。 t.test(a,b)t检验sub("PE","",tmp)替换；unique(sub("PE","",tmp))boxplot(log(exprSet+1))注意要＋1；exprSet<-exprSet[apply(exprSet,1,function(x) sum(x>1) > 5),]a<-read.csv("*.csv",stringsAsFactors)<-F)
42.略
vignette()查看某个包的帮助文档。如
vignette("stringr")ggpubr boxplot 搜索
localhost 查看服务器
HTML](https://www.w3school.com.cn/html/index.asp)及HTML DOM基础知识，实例：peerJ期刊探索、爬取开放期刊影响因子及审稿时长等
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R基础绘图：
text(a,b,,labels=" ",font=1，...)#a,b指坐标，font字体，cex方法倍数，pch符号（点的样式），lty线的类型，lwd线的宽度rug(cars$dist,side = 2)rug坐标轴及密度，bty边框grid(nx=NA, ny=8, lwd=1, col='skyblue')grid网格type=p、l、c、s等： 点、线、其他
plot(pv~uv,xlab=R.version.string,ylab = Sys.time())Sys.time()pv <- sample(100,10)sample()segments(pv[1],uv[1],pv[5],uv[5])线段arrows(1,3,8,3,angle = 60);text(9,3,'angle=60')箭头类型 angle=0,30,60,90lines()折线图，barplot()柱状图(beside=T)、条形图(horiz=T)，#设定颜色 library(RColorBrewer) col <- brewer.pal(11,'Spectral')[1:11]title(main= ,sub= )#ggplot作图 ggplot(mpg, aes(displ, hwy,color=class)) + geom_point() + facet_wrap(~class) ggplot(mpg, aes(hwy)) + geom_histogram() #直方图 ggplot(mpg, aes(manufacturer)) + geom_bar() #柱状图 ggplot(mpg, aes(hwy)) + geom_freqpoly() #频率多边形 ggplot(economics, aes(date, unemploy / pop)) +geom_line() #时间序列 ggplot(economics, aes(unemploy / pop, uempmed)) + geom_path() #路径图 P13、P20（10min）、P31-33习题讲解 暂时跳过
安装包常用命令：
install.packages(" ",repos = "http://mirror./////")
BiocManager::install(" ")
devtools::install_github("davidgohel/ReporteRs")
