Cell | 根据微环境对癌症进行分类可能会改变免疫治疗的观点
原创 图灵基因 图灵基因 2022-01-13 10:55
收录于话题#前沿分子生物学机制
加州大学旧金山分校（UCSF）的研究人员进行的一项研究展示了一种看待癌症免疫疗法的新方法。研究人员从78名加州大学旧金山分校的临床医生那里获取了肿瘤标本，调查了364例患者的肿瘤活检样本，并根据他们的免疫微环境对他们进行了分组。
他们的研究结果发表在《Cell》杂志上的一篇题为“Discovering dominant tumor immune archetypes in a pan-cancer census”的论文中，由第一作者Alexis Combes博士和Bushra Samad以及资深作者Max Krummel博士领导。
研究人员写道：“癌症在起源组织、驱动突变和周围组织的其他特征方面表现出显著的异质性。个体肿瘤很可能参与免疫系统的共同模式，即‘原型’——创造典型的非破坏性肿瘤免疫微环境（TME）并调节肿瘤靶向性。为了发现主要的免疫系统原型，UCSF Immunoprofiler Initiative（IPI）使用标准化方案处理了12种癌症类型的364个个体肿瘤。”
“这是一个如何看待癌症患者的新框架。”加州大学旧金山分校病理学系D2B CoLab主任兼即将上任的助理教授Combes说，“这项工作将帮助临床医生找到合适的生物来靶向并避免靶向肿瘤中不存在的细胞。”
研究人员试图确定为什么免疫疗法对某些人有效，而对另一些人无效。
“这比反应者和无反应者更复杂。”加州大学旧金山分校Robert E. Smith实验病理学教授兼Krummel实验室主任Krummel解释道，“我们的目标是了解对这些靶向疗法有多少反应。”
研究人员观察到，各种癌症都以规定的形式出现。他们对肿瘤中不同的微环境进行了表征，观察了哪些免疫细胞存在以及哪些基因被表达。
“我们可以看到肿瘤及其环境相互影响。”研究人员说。
研究人员将肿瘤分为12组，并将它们称为原型。他们观察到，除了作为当前免疫疗法重点的T细胞之外，肿瘤还含有广泛的免疫细胞，例如巨噬细胞、NK和B细胞。
“对包括基因测序、细胞表面标记、成像和患者临床数据在内的多种数据源进行无偏见的询问，为我们能够识别和描述这些免疫原型奠定了基础。”加州大学旧金山分校的数据科学家Samad补充道。
使用这种分组框架不仅可以确定哪些肿瘤可能易受当前免疫疗法的影响，而且还可以确定哪些患者在哪些临床试验中可能最有反应。
“这个框架使我们能够消除大量噪音。”研究人员说，“我们可能一直在瞄准甚至不在肿瘤中的细胞。”
“这只是这个项目的开始。”研究人员说，“我们相信这是癌症治疗个性化医疗的下一步。当你设计的免疫疗法可以与正确的生物相对抗时。生物可能并不总是以我们迄今为止已知的名字命名。我们认为原型就是这些名字。”
