2022-05-20

取子集即简单筛选数据

加载csv并赋值为xm

xm <- read.csv(省略)
class(xm)
is.na(xm)

1、which筛选

示例1:提取前10行,第1,6,7列的内容,赋值xm1

xm1 <-xm[c(1:10),c(1,6,7)] #提取前10行,第1,6,7列的内容,赋值
View(xm1)#View以单独的窗口展示列表

示例2:对xm进行pct.1>0.5条件筛选,赋值为xm2

xm$pct.1
xm2 <- xm[which(xm$pct.1>0.5),]#注意加逗号,指定行列
View(xm2)

示例3:多个条件进行筛选
两个列条件筛选的交集,要用同一个which,放在小括号中,用&连接😀

xm3 <- xm[which(xm$pct.1>0.5&xm$pct.2<0.5),]#两个列条件筛选的交集,要用同一个which
View(xm3)

本来是这样试的,发现取的是并集

xm4 <- xm[which(xm$pct.1>0.5)&which(xm$pct.2<0.5),]


2、subset取子集筛选

对象,筛选条件

subset(xm,xm$pct.1>0.5&xm$pct.2<0.5,)
xmsubset <- subset(xm,xm$pct.1>0.5&xm$pct.2<0.5,)
View(xmsubset)

对象,筛选条件,添加select取出哪几列进行展示

xmsubset2 <- subset(xm,xm$pct.1>0.5&xm$pct.2<0.5,select = c(pct.1,pct.2,gene))
View(xmsubset2)

【注】

  • View首字母大写
  • 操作之后记得赋值,赋值之后才能改写,否则只是展示
  • 重复命名会覆盖之前的,取名不要重复,也不要为了好写太简单
  • 不在当前工作路径的,读入时候要写全路径,用Tab进行补全,很方便

😀 😀

😀

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