音乃木坂学园,这所在秋叶原，神田和神保町这三条街上的传统学校面临着废校的危机。
可是并没有过去多久，一股巨大的现金流注入到了学园的财务系统，学园的废校危机就这样悄无声息的解决了。
另一团阴云重新笼罩在了音乃木坂学园，那是在资金流注入学园后一个月左右发生的事情。
一名女生失踪了，在失踪的数日之后，人们在学园的一个仓库里发现了她的尸体，肢体已经残缺不全，心脏也被人挖走了。
就在女生失踪的那一天，学园买进了一套新的音响设备，说是给学生演出使用。
失踪学生死亡的事情在当地引起了巨大的轰动，警部对案件的重视，派了大量的人员进行调查，结果却收获寥寥，随着时间的慢慢流逝，相关线索的不足，整个案件也不了了之，最终，作为一场悬案慢慢的淡出了人们的视线。
在案件调查期间，一个从音乃木坂学园走出的偶像团体，逐渐引起了人们的关注。
距离疑案发生过去了三个月后，又一名女生失踪了。
在搜寻过程中，警方在学园里发现了一些残缺的人类肢体。通过DNA技术彼对，和失踪女生的基因一致。
基于之前失踪案的情况，对于失踪学生的下落，舆论普遍认为凶多吉少，然而在数天之后，失踪的女生毫发无伤的回到了自己的家中，失踪期间的记忆则完全想不起来了。
又是一场悬案。
随着调查的深入，一个隐藏在学园的秘密宗教团体，慢慢浮出水面...
