文献信息：
标题：A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome
中文：来自人肠道metagenome的20万参考基因组database
单位：EMBL-EBI
杂志：NBT
时间：2020
摘要：
全面、高质量的参考基因组对于人类肠道菌群的功能描述和分类鉴定是必需的。我们展示了统一的人类胃肠道基因组(UHGG)集合，包括来自4644个肠道原核生物的204,938个非冗余基因组。这些基因组编码> 1.7亿个蛋白序列，我们在统一的人类胃肠道蛋白(UHGP)目录中对其进行了整理。与综合基因目录中的蛋白质相比，UHGP的肠道蛋白质数量增加了一倍多。超过70%的UHGG物种缺乏培养代表，40%的UHGP缺乏功能注释。种内基因组变异分析显示有大量的附属基因和单核苷酸变异，其中许多是特定于个体人群的。UHGG和UHGP将有助于研究人类肠道微生物组中的基因型和表型。
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http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/metagenomics/mgnify_genomes/human-gut/v1.0/
