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  • 【最新汇总】单细胞转录组分析与绘图系列

    分析 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzMzE5NT...

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    答读者问(8):如何批量查询marker基因(对应的蛋白)会不会在膜上表达?

    做实验的朋友们对这个问题应该是很感兴趣的,因为涉及到后续能不能实验验证。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文献,查网站。我知道的:unipro...

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    【单细胞高级绘图】11.marker展示_分组气泡图

    忙里偷闲,整理了一套绘图代码,代码300行,效果如上图所示:其实就是把单细胞转录组中常见的气泡图根据分组信息展开了,代码目前适用于分组后leve...

  • 如何获取kegg通路的基因列表

    如何获取kegg通路的基因列表?相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表?举两个例子: 在找差异基因这一步,只想针对特定通路的基...

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    一个对接CellPhoneDB的R包

    首先祝大家新年快乐!新的一年paper多多,顺顺利利! cpplot:Visualize the results of cell-cell co...

  • CellPhoneDB三个版本(V2、V3、V4)之间的对比

    上个月在小组会上做了一期细胞互作的分享,目前剪了一部分出来。后续还有cellchat、nichenet以及演示的部分,等剪辑好了再发。 视频介绍...

  • 10套代码让你学会单细胞高级绘图

    4000+人次获取代码 高级绘图这个系列已经出了10期了,最开始的出发点是想把用过的不错的代码整理出来,方便自己也帮助大家。从第1篇300+小伙...

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    【单细胞高级绘图】10.KEGG富集结果的圆圈图

    本次教程的figure仍然是读者求助的图,算得上是kegg富集图的新流派。据我的调查,该图应该是基迪奥云-平-台首创(https://www.o...

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    【单细胞高级绘图】09.细胞通讯_两组比较_连线图

    上周一位读者联系我,让我帮忙发一个绘图的单子。在朋友圈发单后,感兴趣的朋友很多,有十几位还私聊我让我分享一下代码,可见大家还是很感兴趣的。不过等...

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top2读研,学习方向:癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学