停了2天，没写文献阅读体会，因为感觉乱糟糟的，需要好好整理一下：1、每天没有留够足够的时间来看文献，哪怕一小时，也是全部看文献的1小时。2、宜早不宜迟，不是说晚上1小时看文献不好，而是晚上看，更容易心态崩，一不小心就熬夜到第二天了。没了，新的一天开始，从看文献开始。
阶段性的香荚兰基因组，啥是阶段性的？
单倍型是什么？没理解
是单倍体基因型的简称。一个染色单体里面具有统计学关联性的一类单核苷酸多态性。
首先，定义是一条染色体上至少存在2个等位基因位点，这样的等位基因位点组合叫做单体型。如：
染色体1：******T******G******
染色体2：******C******A******
染色体3：******T******A******
那么，TG,CA,TA分别是染色体1、2、3的单倍型。
基因组草图、全图是有哪些区别？分别能用来做什么（或者叫优缺点是什么？）
http://blog.sina.com.cn/s/blog_ce5c0da60101dxp0.html
之前有文章发表了草图，本文是全图
结果与分析
1 香荚兰基因组揭示了单倍型的不同
二代和三代结果共同组装了一个高质量的基因组，并挂载到染色体上。基因组大小1480.0Mb（包含了736.8Mb和744.2Mb的单倍型A和B）
2 香荚兰基因组的进化
比较基因组分析:7个香荚兰属Vanilla植物，3个兰科植物，裸子植物作为外类群（银杏、无油樟），9个挑选的非兰科单子叶植物，4个选择的双子叶植物。
WGD事件
3 重测序揭示多样性
4 单倍型具体基因在香兰素生物合成中的作用
5 深入理解香兰素合成途径
6 鉴定香荚兰豆开裂的候选基因
吸取教训
先通读文献，有不同的问题先写到一边。一遇到问题就查，那样文章都读不了，主次分不清。
