肠道微生态菌群一直是科研界的研究重点，也是FMT治疗施行的关键验证环节。很多实验是使用小鼠作为实验验证的动物模型。从文献得知还有人体肠道微生物生态系统模拟物。
人类胃肠道微生物群在维持宿主健康和预防疾病方面发挥着至关重要的作用，这促使科研人员开发模拟器来复制这一复杂系统。人体肠道微生物生态系统模拟器（SHIME®）作为一种多室动态模拟器，已成为研究人体肠道微生物群内部相互作用与干扰的关键体外模型。其连续实时监测特性与程序化灵活设置相结合，使SHIME®能够以高动态性和稳定性模拟整个人体肠道生态系统，从而在受控环境中评估各种处理方式对肠道菌群的影响。本文综述了SHIME®系统的最新进展，包括M-SHIME®、Twin-SHIME®、Triple-SHIME®及Toddle SHIME®等模型，重点阐述了其在食品营养科学、药物研发、肠道健康研究和传统中药等领域的应用。此外，本文还探讨了SHIME®与其他先进技术融合的前景。研究结果凸显了SHIME®技术的多功能性，既证明了其对当前肠道生态系统研究的重要贡献，也展现了其在微生物组相关领域未来创新中的潜力。
Lambrecht等人采用M-SHIME®模型评估了含有多个抗生素抗性基因的抗性质粒从共生大肠杆菌向人类肠道微生物群的转移情况。该研究揭示了水平基因转移的风险——这种转移可能促进抗生素抗性在肠道内的传播，对人类治疗策略构成重大挑战[79]。
Simulator of the Human Intestinal Microbial Ecosystem (SHIME®)
Zhu W, Zhang X, Wang D, Yao Q, Ma GL, Fan X. Simulator of the Human Intestinal Microbial Ecosystem (SHIME®): Current Developments, Applications, and Future Prospects. Pharmaceuticals (Basel). 2024 Dec 6;17(12):1639. doi: 10.3390/ph17121639. PMID: 39770481; PMCID: PMC11677124.
