生信小书童 - 简书

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ESMFold 文章学习
ESMFold 和 OmegaFold 类似，都是将 MSA 和 template 的输入模块用一个预训练的蛋白质语言模型代替，然后再接一个与 ...

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X-Atlax/Orion 数据集
Xaira Therapeutics[https://www.xaira.com/our-approach] 于 2024 年 4 月注册成立，...

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scBaseCount 数据集
Arc Institute[https://arcinstitute.org/about] 是一家总部位于加利福尼亚州帕洛阿尔托的非营利研究机构...

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Tahoe-100M 数据集
Tahoe Therapeutics（前身为 Vevo Therapeutics）[https://www.tahoebio.ai/news/o...

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蛋白结构相似评价指标
1 蛋白结构相似评价指标 RMSD 是局部精度之王，但“大蛋白天生吃亏，一个远点就寄”。GDT_TS 是 CASP 老将，稳健但有点“粗粒度”。...

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AlphaFold2 文章学习
2021年 DeepMind 发布的 AlphaFold2 开启了 AIDD 时代，它的作者 Jumper 和 Hassabis 也因此获得了 ...

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单细胞差异表达基因与细胞注释的maker基因
1 差异表达基因与 maker 基因的关系单细胞注释使用的 marker 基因与差异表达分析得到的上调基因高度一致，两者可以相互印证确保注释结...

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《大语言模型》读书笔记
参考《大语言模型》

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Sanger 和 Sanofi 验证 scRNA-seq 证据提升药物通过临床审批的文章
结论通过 scRNA-seq 分析发现，以下两种类型的靶点能显著提高基因–疾病配对成功进入临床的概率（1）在疾病相关组织中呈现特定细胞类型的...

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