小干扰RNA（siRNA）是一种短小的双链RNA分子，通常由21-25个核苷酸组成。它通过与RISC（RNA诱导靶向剪切复合物）结合，导致特定mRNA分子的降解，从而达到抑制或敲降目标基因表达的目的，这一作用也叫做基因干扰或基因沉默。
siRNA转染即是利用这类小干扰RNA来靶向并沉默特定基因的一种技术，这项技术通过将siRNA瞬时导入细胞中，从而利用RNA干扰（RNAi）机制来降低靶基因的表达，目前已广泛应用于基因功能研究和疾病防治等领域。这其中还涉及到一个非常重要的环节就是siRNA的设计与合成，绝大多数研究者都会考虑找合成生物公司来设计，而这就十分考研技术人员的专业能力和设计合成经验，合理有效的siRNA设计不仅可以提高siRNA的转染效率，还可以获得对目的基因更理想的敲低效果。下面我们就展开讲一讲。
关于siRNA的设计与合成，其关键在于实现高度的靶标特异性，这对于siRNA转染实验来说可谓是至关重要的。不合理的序列设计可能导致siRNA与靶基因的结合亲和力降低，即所谓的“脱靶效应”或者引发潜在的非特异性基因沉默，从而影响转染效率。此外，siRNA序列中的GC含量也会对转染效率产生影响。一般来说，GC含量适中（约40%-60%）的siRNA转染效率相对较高，GC含量过高或过低都可能影响siRNA的稳定性和与细胞内相关蛋白的相互作用，进而降低转染效果。因此，为了提高siRNA的特异性和转染效率，专业的生物合成公司，如百代生物、赛索飞、吉玛等等，在进行siRNA设计时会多方位考虑各个因素，包括与潜在脱靶位点的不匹配程度、种子区域的互补性、GC含量以及其他可能带来负面影响的序列特征，以保证能够更加精准的识别目的基因的mRNA并对其进行敲降。
对于初次进行siRNA转染实验的研究者来说，最好选择定制siRNA的三保一套餐，即其中会包含三条目的基因siRNA序列，合成公司会保证至少有一条siRNA序列对目的基因mRNA具有显著的降解作用；此外，套餐中还包含阴性对照、阳性对照以及带荧光标记的阴性对照，方便研究者进行不同的实验设计与验证，可以说非常有用！
