ABCC2

#ABCC2

序列:Gene: ABCC2 (ENSG00000023839) - Marked-up sequence - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 104

位置:Chromosome 10: 99,782,640-99,852,594     GRCh38:CM000672.2

简介:This gene has 10 transcripts (splice variants)125 orthologues11 paralogues and is associated with 2 phenotypes.

转录本ATG区和UTR区:Transcript: ABCC2-207 (ENST00000648689.1) - Exons - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 104


#SNP

rs717620 - SNP - NCBI (nih.gov)  [Hide Flanks]

位置:chr10:99782821 (GRCh38.p12)                   10:101542578 (GRCh37)


#SNP命名原则

手把手学习TCGA数据库:SNP突变分析第一期_基因组 (sohu.com)

干货 | 如何查找目标基因序列?掌握这几招就够了!(Ensembl篇) _数据库 (sohu.com)

一文看懂NCBI的refseq (360doc.com)

NCBI工具:BLAST 2 Sequences的用法 – 柳城 (liucheng.name)

如何在ensembl数据库中查找目标序列的上下游序列 (sohu.com)

人类参考基因组GRCh37 VS GRCh38 - 知乎 (zhihu.com)

近期工作目标:

[if !supportLists]1.      [endif]SNP靶点设计

[if !supportLists]2.      [endif]ABCC2 7901细胞系敲除单克隆验证。

[if !supportLists]3.      [endif]ABCC2 claudin18.2的关系。

[if !supportLists]4.      [endif]ABCC2对胃癌细胞系耐药、功能、形态的影响

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。
禁止转载,如需转载请通过简信或评论联系作者。

相关阅读更多精彩内容

  • 刘小泽写于2020.5.28Ensemble转Symbol其实不是这么简单,问题百出,需要留意 0 今天遇到一个需...
    刘小泽阅读 12,868评论 4 62
  • 前情提要 搞NGS,注释文件是我们经常需要用到的。但是不同的实验室偏爱的数据库各不相同,甚至同一个课题组的小伙伴都...
    超级无敌大蜗牛阅读 20,625评论 1 37
  • 1. 如何选择参考基因组?——李恒2017年年底博客 1.1 三种选择 如果比对到GRCh37/hg19,使用: ...
    TOP生物信息阅读 14,436评论 0 19
  • 我是黑夜里大雨纷飞的人啊 1 “又到一年六月,有人笑有人哭,有人欢乐有人忧愁,有人惊喜有人失落,有的觉得收获满满有...
    陌忘宇阅读 12,764评论 28 53
  • 信任包括信任自己和信任他人 很多时候,很多事情,失败、遗憾、错过,源于不自信,不信任他人 觉得自己做不成,别人做不...
    吴氵晃阅读 11,368评论 4 8

友情链接更多精彩内容