Linux下的软件安装
miniconda
专门做生信的软件管理器
安装步骤
1、输入bzip2
2、cd biosoft进入wgt下载地址 一路yes,一路enter
3、source ~/.bashrc来激活conda
装国内镜像
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
使用软件
- 查看当前所有软件列表 conda list
- 搜索软件 conda search 8888
- 安装软件 conda install fastqc -y
- 卸载软件 conda remove fastqc -y
心得
今天装的很不顺利，那个删除miniconda 一直出错。结果让我体会到rm -rf的命令。
小白摸索ing
