文献信息:
标题:Galactic Circos: User-friendly Circos plots within the Galaxy platform
中文:用户友好型galaxy circos绘图平台
杂志:gigascience
时间:2020.12
Github:https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/circos
介绍:https://training.galaxyproject.org/training-material/topics/visualisation/tutorials/circos/slides.html#6
手册:https://training.galaxyproject.org/training-material/topics/visualisation/tutorials/circos/tutorial.html
基于win还是linux???
可用的galaxy circos web服务:
usegalaxy.eu
usegalaxy.org
usegalaxy.org.au
摘要:
背景
Circos是一个流行的、高度灵活的软件包,用于复杂数据集的圆形可视化。Circos在基因组分析领域尤其流行,它支持任何分析数据的交互式绘图,包括替代科学领域数据和非科学数据。这种高度的灵活性也伴随着高度的复杂性,这可能会给没有受过编程或UNIX命令行培训的研究人员带来障碍。Galaxy平台提供了一个用户友好的基于浏览器的图形界面,包含了广泛的“包装”命令行工具,以方便访问。
发现
我们为Circos开发了一个Galaxy wrapper,将Circos的强大功能与Galaxy平台的易用性和易用性相结合。该组合极大地简化了最终用户的Circos图的规范和配置,同时保留了生成复杂多维数据集的发布质量可视化的能力。
结论
Galactic Circos通过Galaxy平台,仅使用web浏览器就可以创建准备出版的Circos图。用户可以下载他们的地块的Circos配置文件的完整集,以便进一步手动定制。Circos的这个版本是作为银河工具棚的开源可安装应用程序提供的,其使用说明在银河培训网络托管的培训手册中。
文中图: