数据库设计

  1. 病人信息表
  2. 样品信息表
  3. 测序记录表
  4. 基因位点表
  5. 变异信息表
  6. 测序变异表
  7. 套餐信息表
  8. 癌症信息表
  9. 结构变异信息
  10. 基因融合变异信息
  11. 药物信息表
  12. 用药信息表

分表字段及数据限制

病人信息表

  1. 姓名
  2. 年龄
  3. 性别
  4. ID
  5. 联系电话
  6. 地址
  7. 医院
  8. 医生
  9. 原发癌症 【外键】
  10. 分析套餐 【外键】

样品信息表

  1. 采样组织类型
  2. 采样时间
  3. 样品量
  4. 样品单位
  5. 病人信息【外键】
  6. 备注

测序记录表

  1. 测序ID
  2. OG ID
  3. CA-PM号
  4. R1
  5. R2
  6. 文件大小
  7. 样品信息【外键】
  8. panel
  9. 测序时间(取测序read文件的最后修改时间)

基因位点表

  1. Chromesome
  2. Start
  3. End
  4. Ref
  5. 基因【外键】// 外键的目的是为了增加参照完整性约束,也可以不设定外键
  6. 最长转录组
  7. 外显子编号

变异信息

  1. 基因位点【外键】
  2. Alt
  3. HGVS.c
  4. HGVS.p
  5. 突变类型
  6. rs number
  7. 千人基因组突变频率
  8. 致病性预测(SIFT,PolyPhen2等)

测序变异信息

  1. 测序记录【外键】
  2. 变异信息 【外键】
  3. 突变频率
  4. 测序深度
  5. 突变深度
  6. 分子标签数

套餐信息表

  1. 套餐名称
  2. 套餐价格
  3. 癌症【外键】

套餐基因表

  1. 套餐ID【外键】
  2. 基因 【外键】

基因表

  1. 基因symbol
  2. 基因Entrez ID
  3. 基因ENSG ID
  4. 基因HGNC ID
  5. 基因全称
  6. 基因详细信息
  7. 备注

癌症信息表

  1. 癌症名称
  2. 癌症详细信息
  3. ...更多信息

拷贝数变异表

  1. 基因 【外键】
  2. Start
  3. End
  4. 拷贝数
  5. 测序记录【外键】

基因融合变异表

  1. 基因1【外键】
  2. Start1
  3. End1
  4. 基因2 【外键】
  5. Start2
  6. End2
  7. 测序记录【外键】

药物信息表

  1. 药物中文名称
  2. 药物英文名称
  3. 药物批准文号
  4. 更多信息

药物被批准用于哪些癌症

  1. 药物 【外键】
  2. 癌症 【外键】

用药信息表

  1. 变异【外键】
  2. 癌症【外键】
  3. 药物【外键】
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