在GMS的MODFLOW中，有RIV、STR和SFR三个子模块包均可以用来模拟河流与地下水的交互作用，区别如下：
一、RIV
- 只追踪河流与地下含水层之间的水流，一旦水流入到河流中，就不再补给地下水，从模型中消失。
- 河流的水位需要人工手动输入。
二、STR
- 现在是STR1，在RIV模块包的基础上演化而来，除了可以模拟河流、地下含水层的水流联系，而且水流可以通过河流网络（支流、河流转弯、与湖泊连接）进行引导输送，允许河流在给定的某一模拟期出现干涸。
具体的实现方法是：通过计算上游的reach中的流入量、与地下含水层交互量，将剩下的水量作为下游的reach中的流入量，以此类推。因此，与RIV不同，流入的河流中的水量不会消失，而是会输送到下游，可能在下游某一地点再次进入到地下含水层中。 - 河流的水位是基于河道水力学计算出的，比如可以选择曼宁公式进行计算。
三、SFR
- 现在是SFR1和SFR2，均是在STR1的基础上演化而来，SFR2是在SFR1基础上演化而来。支持SFR1的所有功能。此外，还支持河流底部非饱和流的模拟，这是与SFR1的最大不同。
