目前，磁共振成像（MRI)作为一种无射线和无损伤的影像学诊断方法， 在胎儿产前畸形诊断中已经显示了独特的优势。胎儿MRI于1983年由Smith等首次报道，国内目前开展胎儿磁共振检查的医院已有几十家，近年来磁共振各分支中，胎儿磁共振检查增长幅度居第一位。
磁共振主要以磁场进行成像，不存在放射线和电离辐射，对胎儿是安全的。到目前为止，还没有证据表明诊断强度的磁场会对胎儿造成危害。尽管如此，孕3个月内由于胚胎处于细胞分化发育期，容易受外界各种物理因素的损伤，为确保胎儿安全，目前一般对孕3个月以内的胎儿不做磁共振检查，实际上，孕3个月以内的胎儿结构太小，磁共振检查也不能获得诊断效果。
尽管超声可以显示脑室形态的轻微变化，但MRI可以更好地显示脑实质情况。MRI能显示胎儿正常脑发育、髓鞘形成过程，不仅可直接显示发育中各结构的发育过程及一过性结构的出现和消失过程，还可以通过信号强度的不同来描述各组织器官的成分，以评价其成熟过程。
孕17周时胎儿各器官发生的主要过程已基本结束，此时，胎儿脑部结构主要由7层结构构成，MRI可清晰显示。以后发育过程中，MRI可直接显示脑沟、脑回、脑干及小脑的形态、脑神经，基底核信号改变，各层脑实质成熟过程（通过信号的改变），主要是白质束的髓鞘化过程。 MRI孕18周时便可显示颞叶脑回、脑干结构及相对较大的侧脑室，孕18周到24周间可观察侧脑室的明显减小，孕20周可识别小脑的主要组织，孕24周时可显示脑桥的背侧部。
在中枢神经系统病变中，对于诊断神经元移行异常、缺血性病变、脑白质病变或是羊水少的病例，产前超声诊断困难。MRI不受孕妇体型、羊水量多少、胎儿颅骨及母体骨盆骨骼影响，可直接显示脑实质、脊 髓及病变与脑脊髓的关系，比超声有一定的优势。 MRI对胎儿大脑、脑沟、脑回、胼胝体、小脑、脑干及脊髓等解剖结构的显示也稍优于超声。
超声对显胼胝体显示比较困难，诊断胼胝体发育不全的主要依据是脑室形态异常，而脑室形态大小正常时易漏诊。
MRI可以显示胼胝体全貌，准确诊断胼胝体疾患。正常胎儿侧脑室三角区宽度不超过10mm，否则可视为脑室扩大。在中枢神经系统病变中，超声往往多种疾病声像图表现相同，包括双侧脑室扩大、双侧脑室形态不规则且扩大、后颅窝间隙增宽、小脑蚓部显示不清等，表现为一些病变的间接征象，容易漏诊真正病变。如超声诊断胎儿后颅窝间隙增宽的病例，MRI也显示后颅窝间隙增宽，同时显示小脑半球、小脑蚓部及脑干有无异常，对大枕大池及蛛网膜囊肿作出鉴别，对Dandy Walker畸形作出诊断。因此，建议在所有产前超声怀疑中枢神经系统病变，诊断不清时，均有必要进行MRI检查进一步明确诊断，进一步完善诊断。
