1895年三月李鸿章为全权代表，赴日本议和。
3月19日，抵达日本马关，当天致函日本外务大臣陆奥宗光，通报自己到达，日本全权办理大臣伊藤博文与陆奥宗光在得知以后，于当天联合署名致函李鸿章，要求他于3月20日下午三点举行第一次会谈。
日本此时国内经济、政治危机，无力再战，但不愿意显露弱点，又在列强调和的压力下，只能通过这次合议取得利益，否则再打下去，恐怕这场战争会被调解，等于白出兵一次。
因此便在会谈中装作强硬，前三次会谈都不同意议和，使李鸿章苦苦哀求，价码越来越高。
3月24日第三次会谈后，李鸿章返回住处时受到枪击。日本方面此时害怕清朝廷不堪受辱而撤回李鸿章，便终于同意议和。
3月25日，伊藤博文到李鸿章住处慰问，致函李鸿章表示合议的具体条款可以延缓几天再讨论。
3月26日，李鸿章复函伊藤博文，感谢他的慰问和日本天皇的关切，询问合议条款延缓一事，最快能什么时候开谈，暴露了清廷急切议和的心理，正中日本人下怀。“于本国关系重大，本大臣谒胜谨念。”
3月30日，李鸿章再次致函伊藤博文，说自己因伤不能会谈，但可以找人代替，希望伊藤博文早日开启会谈。
4月1日，李鸿章再次致函伊藤博文，要求日方送来议和条款，自己会全力筹商，逐条阅读。需要注意的是，李鸿章遇刺后日方才提出了议和条款，因此李鸿章遇刺并没有对条款造成任何改动，并且由于他显露出急切的议和欲望，导致日方得以漫天要价，朝野为之振奋。
我们称李鸿章是当时卓越的外交家，是因为他能够与各国和平、理性的交谈，已经是冠绝清朝，但在外交事务上来看，还是过于稚嫩。
4月10日，终于开启第五次会谈，李鸿章将中方能够接受的条款给伊藤博文过目，伊藤博文再次与他讨价还价，最终敲定《最后修正案》。明令李鸿章不要再分辨，在4月13日前说同意还是不同意，不同意便再次开战。
4月11日，伊藤博文再次致函李鸿章，说日本政府已经仁至义尽，希望李鸿章于4月13日务必给予答案，否则战争之结果难以预料。
4月12日，李鸿章受到清廷内部压力，复函伊藤博文，称日方要求“与独立国之君主权大有相抵触者”，希望再商量商量。
4月13日，伊藤博文复函李鸿章，声称日方已经为“媾和而做出最极限之让步”，不允许再分辨什么。
4月17日，李鸿章与伊藤博文正式签署马关条约。
4月20日，明治天皇批准条约，伊藤博文致电已经登船回国的李鸿章，要求清国皇帝也批准此条约。
此后的两个月间，李鸿章与伊藤博文多次书信往来，协助处理日方占领威海卫和占领台湾的具体事务。
1895年7月25日，李鸿章致函伊藤博文，要求修改马关条约中对清军在威海卫驻军的限制，伊藤博文没有搭理他。
1895年9月11日，伊藤博文回函称马关条约已经生效，不允许任何修改。
整个马关条约签订过程中，伊藤博文只有恐吓、威胁，李鸿章对此毫无办法，他奉慈禧命令全权指挥甲午战争，结果战败，遭受朝廷内部指责，非常狼狈，因此在议和过程中不敢如之前那样坚持己见，而是多次装样子与伊藤博文讨价还价，但浅尝辄止，回国以后自居为已经努力。
综上所述，李鸿章遇刺对马关条约毫无影响，马关条约是伊藤博文单方面的舞台，日本人要什么，清国人就给什么，不允许分辨，倘若敢丝毫分辨，日方则恐吓曰“战争之结果不知如何也”。
参考文献：《李鸿章与伊藤博文书信考》《李鸿章年谱》
