Linux环境下的软件安装
特别鸣谢:@公众号:生信星球 豆豆&花花
真是一语惊醒梦中人哪!以前经常听到或者看到conda/anaconda,今天在高人点拨下,终于知道原来conda就是Linux的“App Store”,并顺手盗取了老师的图😝莫怪莫怪。
先来张思维导图梳理一下今天学到的内容。
需要注意的问题
1. 根据服务器型号,下载对应版本的Miniconda
- 查看服务器型号:
uname -a
- 下载地址:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
- 安装:
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
注意:安装过程中,逢Enter点Enter,逢yes/no选yes。
- conda激活:source ~/.bashrc
注意:这一步必须有!不能省!!!
2. 添加镜像
#清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
3. 使用Conda
- 查看软件列表:
conda list
- 搜索软件:
conda search 软件名
- 安装软件:
conda install 软件名 -y
注意: -y是自动安装,可加可不加。根据实践经验,加上更好。
- 卸载软件:
conda remove 软件名 -y
- Conda环境
- 查看环境:
conda info --envs
(前边带*的为默认环境) - 新建环境:
conda create -n 环境名
- 激活环境:
conda activate 环境名
(可以查看环境,看是否激活) - 退出环境:
conda deactivate
- 卸载环境中的软件:
conda remove -n 环境名 软件名
- 卸载环境:
conda remove -n 环境名
- 查看环境:
注意:卸载环境前必须先退出环境。
以上,就是今天学到的内容。